بررسی نقش lncrnaهای مرتبط با سلول‌های t در عود گلیوبلاستوما با استفاده از تحلیل توالی‌یابی rna تک سلولی

مقدمه: گلیوبلاستوما (glioblastoma) gbm، یکی از تومورهای بدخیم اولیه سیستم عصبی مرکزی است. محدودیت‌های جراحی و مقاومت به درمان، از چالش‌های مهم درمان آن محسوب می‌شوند. گلیوبلاستوما، به دلیل ناهمگنی ژنتیکی، حضور سلول‌های بنیادی سرطانی (cancer stem cells) csc و ریزمحیط توموری منحصر به فرد (tumor microenvironment) tme نرخ عود بالایی دارد. تغییرات ژنومی و بیان ژنی که در تومور عودیافته رخ می‌دهد، با تومور اولیه متفاوت است. هدف این مطالعه، شناسایی lncrnaهای مرتبط با سلول‌های دخیل در عود و بررسی نقش آن‌ها در تنظیم پاسخ ایمنی و مکانیسم‌های مربوطه با استفاده از تحلیل بیوانفورماتیکی داده‌های rna تک ‌سلولی بود.روش‌ها: در این مطالعه با آنالیز اطلاعات توالی‌یابی rna تک سلولی (cell rna sequencing seq) single scrna، تفاوت‌های بیان lncrnaها در گونه‌های مختلف سلولی (cell type) گلیوبلاستومای اولیه و عودیافته بررسی شد. تحلیل داده‌ها با استفاده از پکیج singler انجام گردید. سلول‌های متفاوت، بر اساس الگوی بیان ژنی به چهار نوع مختلف دسته‌بندی شدند که سلول‌های t به دلیل نقش کلیدی‌شان در ریز‌محیط توموری و ایمنی جهت مطالعه انتخاب شدند.یافته‌ها: نتایج نشان داد که یازده lncrna از جمله linc01088، pvt1 و kcnq1ot1 در سلول‌های t بین گلیوبلاستومای اولیه و عود یافته تفاوت بیان معنادار دارند.نتیجه‌گیری: این مطالعه بینش‌های جدیدی در زمینه‌ی تفاوت‌های بیان ژنی بین گلیوبلاستومای اولیه و عودیافته و نقش lncrnaها به عنوان اهداف درمانی بالقوه ارائه می‌دهد. همچنین احتمالاً این lncrnaها می‌توانند از طریق تنظیم بیان ژن‌های و مسیرهای مرتبط با سرطان، در شکل‌گیری و عود مجدد گلیوبلاستوما نقش داشته باشند. نتیجه‌گیری دقیق و نهایی نیازمند مطالعات تکمیلی است.

investigating the role of t-cell-associated lncrnas in glioblastoma recurrence using single-cell rna sequencing analysis

background: glioblastoma (gbm) is one of the primary malignant tumors of the central nervous system. surgical limitations and resistance to therapy are important challenges in its treatment. this cancer has a high recurrence rate due to genetic heterogeneity, the presence of cancer stem cells (cscs), and a unique tumor microenvironment (tme). the aim of this study is to identify lncrnas associated with cells involved in recurrence and to investigate their role in regulating the immune response and related mechanisms using bioinformatic analysis of single-cell rna data.methods: in this study, the differences in lncrna expression among various cell types in primary and recurrent gbm were investigated using single-cell rna sequencing (scrna-seq) analysis. data analysis was performed using the singler package. cells were classified into four distinct types based on gene expression patterns. among these, t cells were selected for further study due to their key role in the tumor microenvironment and immune response.findings: the different cells were categorized into 4 distinct types based on their gene expression profiles. among these types, t cells were selected due to their pivotal role in the tumor microenvironment and immunity. the results revealed that 11 lncrnas, including linc01088, pvt1, and kcnq1ot1, exhibited different expression levels in t cells between primary and recurrent gbm.conclusion: this study provides new insights into the differences in gene expression between primary and recurrent gbm and highlights the potential of lncrnas as therapeutic targets. it is likely that these lncrnas play a role in glioblastoma formation and recurrence by regulating cancer-related gene expression and pathways. definitive and final conclusions require further complementary studies.