|
|
|
|
شناسایی یک اپیتوپ مشترک برای انسولین در 2 سرور مختلف
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
الفتی سیما ,اسمعیل لشگریان حامد ,جلالوند معصومه ,زند مریم ,جلالوند امیرمسعود ,آب خوئی لیلا
|
|
منبع
|
مجله دانشكده پزشكي اصفهان - 1404 - دوره : 43 - شماره : 827 - صفحه:978 -979
|
|
چکیده
|
مقدمه: مهمترین نکته در مورد پاتوژنز دیابت خودایمنی ایدیوپاتیک مربوط به وجود اتوآنتیژنهای اصلی است. یکی از این اتوآنتیژنهای مهم که به عنوان اهداف خودایمنی هومورال در دیابت نوع 1 شناسایی شده است، انسولین است. اتوآنتیبادیهای انسولین اغلب اولین اتوآنتیبادیهایی هستند که در افراد مبتلا به دیابت نوع 1 شناسایی میشوند. شناسایی اپیتوپهای اختصاصی انسولین که توسط سلولهای t شناسایی میشوند، ممکن است به توسعه واکسنهایی که برای جلوگیری از تخریب خودایمنی سلولهای بتای پانکراس در دیابت طراحی شدهاند، کمک کند.روشها: هدف از مطالعهی حاضر، تعیین موثرترین اپیتوپها برای طراحی واکسنی بود که انسولین، یک اتوآنتیژن مهم مرتبط با دیابت نوع 1، را هدف قرار میدهد. پایگاه داده uniprot توالی اسید آمینه انسولین را ارائه داد که برای شناسایی اپیتوپ از سرور iedb استفاده شد. در فرایند شناسایی اپیتوپ، ما از آللهای شایع انسانی drb1*01:01، drb3*01:01، drb4*01:01 و drb5*01:01 استفاده کردیم که هر کدام شامل 15 جفت باز هستند.یافتهها: توسط دو سرور (http://tools.iedb.org/mhcii/iedb) (http://tools.iedb.org/tepitool, tepitool) یک اپی توپ مشترک برای انسولین شناسایی شد. توالی این اپی توپ مشترک برای انسولین در این دو سرور ergffytpktrreae بود.نتیجهگیری: از آنجایی که توسعه طراحی واکسن برای بیماریهای با شیوع بالا مانند دیابت، نویدبخش درمان و پیشگیری از این بیماریها است، در این مطالعه تصمیم گرفتیم اپیتوپ رایج مرتبط با انسولین را که جزء کلیدی در طراحی واکسن است، شناسایی کنیم.
|
|
کلیدواژه
|
انسولین، اپی توپ، واکسن
|
|
آدرس
|
دانشگاه علوم پزشکی لرستان, دانشکدهی پزشکی, گروه زیست فناوری پزشکی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی لرستان, دانشکدهی پزشکی, گروه زیست فناوری پزشکی و ژنتیک, ایران, دانشگاه علوم پزشکی لرستان, دانشکدهی پزشکی, گروه زیست فناوری پزشکی و ژنتیک, ایران, دانشگاه علوم پزشکی زنجان, گروه زیست فناوری پزشکی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی لرستان, دانشکدهی پزشکی, گروه زیست فناوری پزشکی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی لرستان, دانشکدهی پزشکی, گروه زیست فناوری پزشکی و ژنتیک, ایران
|
|
پست الکترونیکی
|
lilaabkhooie@yahoo.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
identification of a common epitope for insulin in 2 different servers
|
|
|
|
|
Authors
|
olfati sima ,esmaeil lashgarian hamed ,jalalvand masumeh ,zand maryam ,jalalvand amirmasoud ,abkhooie leila
|
|
Abstract
|
background: the most important point about the pathogenesis of idiopathic autoimmune diabetes is related to the presence of major autoantigens. one of these important autoantigens that has been identified as targets of humoral autoimmunity in type 1 diabetes is insulin. insulin autoantibodies are often the first autoantibodies to be detected in individuals with type 1 diabetes. the identification of unique insulin epitopes that can be recognized by t cells could help in the development of vaccines aimed at preventing the destruction of pancreatic beta cells in diabetes.methods: the objective of the present investigation was to ascertain the most effective epitopes for the designing of a vaccine aimed at insulin, a significant autoantigen associated with type 1 diabetes mellitus. the uniprot database provided the amino acid sequence of insulin, which was used for epitope identification from the iedb server. in the process of epitope identification, we employed the prevalent human alleles drb1*01:01, drb3*01:01, drb4*01:01, and drb5*01:01, each of which comprises a length of 15 base pairs.findings: a common insulin epitope was identified using two iedb servers: the iedb mhc-ii binding prediction tool (http://tools.iedb.org/mhcii/) and tepitool (http://tools.iedb.org/tepitool/). the consensus epitope sequence was ergffytpktrreae.conclusion: since the development of vaccine design for high-prevalence diseases such as diabetes holds promise for the treatment and prevention of these diseases, in this study we decided to identify common epitopes associated with insulin, which is a key component in vaccine design.
|
|
Keywords
|
insulin; type 1 diabetes; vaccine
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|