جداسازی و شناسایی مولکولی و الگوی حساسیت آنتی‌بیوتیک رودوکوکوس‌های جدا شده از بیماران مبتلا به سرطان در شیراز

مقدمه: شیوع عفونت‌های فرصت‌طلب، مانند عفونت‌های ناشی از گونه‌های رودوکوکوس، یک مساله‌ی مهم در افراد دارای نقص ایمنی، به‌ویژه بیماران مبتلا سرطان است. از این‌رو با توجه به شیوع روزافزون انواع سرطان‌ها و عوارض ثانویه‌ی آنها در ایران، هدف از این مطالعه، جداسازی، شناسایی مولکولی و تعیین حساسیت ضد میکروبی ایزوله‌های رودوکوکوس از بیماران مبتلا به سرطان به منظور بهبود مدیریت این عفونت‌ها و مقاومت آنتی‏بیوتیکی بود.روش‌ها: در سال 1402، تعداد 79 نمونه بالینی (مایع پلور، خلط، شستشوی برونش، آبسه دندان، زخم و خون) از بیماران مبتلا به سرطان بر اساس روش استاندارد جمع‌آوری شد. با استفاده از آزمایش‌های فنوتیپی و بیوشیمیایی شناسایی اولیه و pcr و آنالیز توالی 16srrna جنس و گونه‌ی ایزوله‌های رودوکوکوس شناسایی گردید. تست حساسیت دارویی برای هر ایزوله، با استفاده از روش سریال رقت طبق دستورالعمل clsi  2022 انجام شد.یافته‌ها: از 79 نمونه، 13 نمونه (16/45درصد) به عنوان رودوکوکوس شناسایی شدند که به هفت گونه: r. erythropolis r. atherivorans، r. ruber، r. zopfi، r. phenolicus،r. equi  و  r. rhodochrous.تعلق داشتند. شایع‌ترین سرطان‌ها واجد عفونت، بدخیمی‌های خونی شامل all و cll بودند. ایزوله‌ها رودوکوکوس واجد حساسیت بالا به دوکسی‌سایکلین، ایمیپنم و آزیترومایسین بودند، در حالی که نسبت به سیپروفلوکساسین و سفوکسیتین مقاومت نشان دادند.نتیجه‌گیری: نتایج نشان داد که رودوکوکوس‌ها به عنوان عوامل مهم عفونت‌های فرصت‌طلب در بیماران مبتلا به سرطان شیوع، تنوع و دامنه‌ی حساسیت آنتی‌بیوتیکی گسترده‌ای دارند. بنابراین جداسازی، شناسایی و تعیین حساسیت آنتی‌بیوتیکی این باکتری برای مدیریت بهینه عفونت‌ها و کاهش مقاومت آنتی‌بیوتیکی در افراد مبتلا به سرطان اهمیت بالایی دارد.

isolation, molecular identification, and antibiotic susceptibility patterns of rhodococcus species isolated from patients with cancer in shiraz, iran

background: opportunistic infections, including those caused by rhodococcus species, pose a substantial threat to immunocompromised individuals, particularly cancer patients. with the rising incidence of cancer and its associated complications in iran, this study sought to isolate and molecularly characterize rhodococcus isolates from cancer patients. additionally, the antimicrobial susceptibility of these isolates was assessed to enhance the management of rhodococcus-related infections and address emerging antibiotic resistance.methods: in 2023, 79 clinical samples were collected from cancer patients using standard methods. initial identification was performed using phenotypic and biochemical tests, while the genus and species identification of rhodococcus isolates was carried out through pcr and 16s rrna sequence analysis. drug susceptibility testing for each isolate was conducted using the serial dilution method according to clsi 2022 guidelines.findings: out of the 79 samples, 13 (16.45%) were identified as rhodococcus species, comprising seven different species: r. erythropolis, r. atherivorans, r. ruber, r. zopfi, r. phenolicus, r. equi, and r. rhodochrous. these infections were predominantly associated with hematologic malignancies, including acute lymphoblastic leukemia (all) and chronic lymphocytic leukemia (cll). rhodococcus isolates demonstrated high sensitivity to doxycycline, imipenem, and azithromycin but resisted to ciprofloxacin and cefoxitin.conclusion: the results indicated that rhodococcus species are important opportunistic pathogens in cancer patients, displaying notable prevalence, diversity, and varying antibiotic susceptibility patterns. consequently, the isolation, molecular identification, and antibiotic susceptibility testing of these bacteria are essential for effective infection management and the mitigation of antibiotic resistance in this vulnerable population.