جهش در ژن‌های دخیل در بیماری‌های متابولیک ذخیره‌ای لیزوزوم به روش تعیین توالی اگزوم در دو خانواده در استان خوزستان

مقدمه: بیماری‌های ذخیره‌ای لیزوزومی (lysosomal storage diseases) lsds، گروهی از بیماری‌های متابولیک هستند که در اثر جهش‌ در آنزیم‌های لیزوزومی ایجاد شده و منجر به تجمع سوبسترای لیزوزوم می‌شود. بیماری گوچر و نیمن پیک، دو اختلال لیزوزومی اتوزومال مغلوب هستند که به ترتیب در اثر جهش در ژن بتا گلوکوزیداز و ژن اسفنگومیلین فسفودی استراز 1 ایجاد می‌شوند. ابزار تشخیصی قدرتمند مبتنی بر فناوری توالی‌یابی اگزوم (whole-exome sequencing) wes با کمک به تشخیص سریع‌تر، زمینه را برای مشاوره‌ی ژنتیکی مناسب‌تر فراهم می‌کند.روش‌ها: در این پژوهش، پس از نمونه‌گیری در لوله‌ی حاوی ماده‌ی ضد انعقاد edta و استخراج dna، تعیین توالی نسل بعد به کمک روش wes انجام پذیرفت. بعد از یافتن ژن کاندید، به منظور تایید واریانت از روش (poly chain reaction) pcr برای تکثیر و از نرم‌افزار کروماس برای خوانش توالی استفاده گردید.یافته‌ها: نتایج تعیین توالی اگزون 8 ژن gba در فرد بیمار خانواده اول، حاکی از جهش هموزیگوت شناخته ‌شده‌ی بیماری گوچر در ژن gba: c.79c>t:p.i260s بود. نتایج تعیین توالی اگزون 9 از ژن npc1 در فرد بیمار خانواده‌ی دوم، نشان‌دهنده‌ی جهش هموزیگوت در ژن npc1: c.1350c>g.p.i450m می‌باشد که یک ‌واریانت جدید در بیماران نیمن‌پیک است.نتیجه‌گیری: روش wes با ارزیابی هم‎زمان چندین ژن می‌تواند زمان تشخیص واریانت‌های بیماری‌زای بیماری‌های ذخیره‌ی لیزوزومی (lsds) کاهش داده و به درمان بیماران کمک می‌کند.

investigating mutations in genes involved in lysosomal storage metabolic diseases by next-generation sequencing in two families in khuzestan province

background: lysosomal storage diseases (lsds) are a group of metabolic disorders caused by mutations in lysosomal enzymes and lead to the accumulation of lysosomal substrates. gaucher’s disease and niemann-pick are two autosomal recessive lysosomal disorders caused by mutations in the beta-glucosidase gene and sphingomyelin phosphodiesterase 1 gene, respectively. a powerful diagnostic tool based on whole-exome sequencing (wes) technology paves the way for more appropriate genetic counseling by helping with faster diagnosis.methods: in this study, whole-exome sequencing was done using the wes method after sampling in a tube containing edta anticoagulant and dna extraction. after identifying the candidate gene, in order to confirm the variant, the pcr method was used for amplification, and chromas software was used for sequence reading.findings: the results of sequencing exon 8 of the gba gene in the first family patient indicated the known homozygous mutation of gaucher disease in the gba gene: c.79c > t:p.i260s. the results of sequencing the exon 9 of the npc1 gene in the patient of the second family indicated a homozygous mutation in the npc1 gene: c.1350c>g.p.i450m, which is a new variant in niemanpik patients.conclusion: the wes method can reduce the time required to diagnose pathogenic variants of lysosomal storage diseases (lsds) by simultaneously evaluating multiple genes and helping to treat patients.