شناسایی عوامل درماتوفیتوزیس در مشهد با استفاده از روش مولکولی polymerase chain reaction sequencing (pcr sequencing)

مقدمه:درماتوفیت‌ها، گروهی از قارچ‌ها هستند که بافت‌های کراتینه‌ی پوست، مو و ناخن را در انسان و حیوان مورد حمله قرار می‌دهند و عفونت‌هایی تحت عنوان درماتوفیتوزیس (کچلی) ایجاد می‌کنند. از آن جایی که شناسایی قارچ‌های پاتوژن در سطح گونه جهت ردیابی منبع عوامل ایجاد کننده، کنترل و پیش‌گیری و اپیدمیولوژی عفونت حایز اهمیت است، استفاده از روش‌های تشخیصی اختصاصی و حساس برای شناسایی عوامل درماتوفیتوزیس ضروری به نظر می‌رسد.روش‌ها:نمونه‌های بالینی (پوسته، ناخن و مو) مبتلایان به درماتوفیتوزیس در شهر مشهد بر روی محیط کشت مایکوزیل آگار کشت داده شد و سپس، ژنوم کلنی‌های درماتوفیت‌های به دست آمده، توسط کیت مخصوص استخراج گردید. ژن internal transcribed spacer (its) توسط پرایمرهای its1 و its4، تکثیر و سپس، تعیین توالی آن‌ها انجام شد. در نهایت، نتایج توالی‌ها با نرم‌افزار seqman، آنالیز گردید و جواب آن‌ها با موارد موجود در پایگاه داده‌ای قارچی هلند مقایسه شد.یافته‌ها:80 ایزوله‌ی درماتوفیتی در این مطالعه تعیین توالی شدند که شامل 9 گونه‌ی درماتوفیتی و عبارت از 23 مورد (28.8 درصد) trichophyton interdigitale، 18 مورد (22.5 درصد) trichophyton tonsurans، 10 مورد (12.5 درصد) epidermophyton floccosum، 10 مورد (12.5 درصد) trichophyton mentagrophytes، 8 مورد (10.0 درصد) microsporum canis، 4 مورد (5.0 درصد) trichophyton rubrum ، 4 مورد (5.0 درصد) arthroderma benhamiae ، 2 مورد (2.5 درصد) nannizzia fulva و 1 مورد (1.2 درصد) nannizzia persicolor بودند.نتیجه‌گیری: با توجه به گزارش گونه‌های نادر درماتوفیت در این مطالعه، استفاده از روش‌های مولکولی نظیر تعیین توالی ژن its می‌تواند تنوع گونه‌ای درماتوفیت‌ها در یک منطقه را با دقت بیشتری نسبت به روش‌های ریخت‌شناسی (morphology) تعیین کند.