|
|
|
|
شناسایی مورفولوژیک و ژنوتیپیک برخی جدایه‌های آسپرژیلوس محیطی در ایران بر اساس توالی ژن بتا توبولین (βtubulin)
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
شکوهی غلامرضا ,میرهندی حسین ,کردبچه پریوش ,نیک آیین مهناز ,رضایی مته کلایی علی ,عباس تبار مهدی
|
|
منبع
|
مجله دانشكده پزشكي اصفهان - 1390 - دوره : 29 - شماره : 166 - صفحه:2262 -2271
|
|
چکیده
|
مقدمه: آسپرژیلوس‌ها جنس متنوعی از قارچ‌های رشته‌ای شامل گروه‌ها و گونه‌های متعدد هستند. شناسایی این قارچ‌ها از جنبه‌های مختلف مانند بیماری‌زایی، توکسین‌زایی و صنعتی حایز اهمیت است. روش‌های معمول آزمایشگاهی برای افتراق گونه‌های آسپرژیلوس شامل بررسی خصوصیات ظاهری و میکرو سکوپی کلنی می‌باشد. روش‌های فوق وقت گیر بوده و احتیاج به پرسنل مجرب دارد. هدف مطالعه‌ی حاضر، استفاده از تعیین توالی ژن بتا توبولین همراه با داده‌های مورفولوژیک برای شناسایی گونه‌های آسپرژیلوس جدا شده از برخی محیط‌ها در ایران بود.روش‌ها: در این مطالعه حدود 200 سویه‌ی آسپرژیلوس جدا شده از خاک و هوای محیط‌های مختلف، اعم از بیمارستان و اماکن طبیعی و عمومی مورد استفاده قرار گرفتند. تمام ایزوله‌ها روی محیط‌های چاپکس آگار و سابورو کشت مجدد شدند و پس از کشت روی لام مورد شناسایی اولیه قرار گرفتند. dnaی ژنومی تمام ایزوله‌ها به روش خرد کردن با گریندر استخراج گردید و به دنبال آن ژن بتا توبولین (βtubulin) هر یک از نمونه‌ها از طریق واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز (polymeraze chain reaction یا pcr) تقویت گردید و از بین آن‌ها 21 ایزوله به عنوان نمایندگان خصوصیات ماکروسکوپی و میکروسکوپی تعیین توالی گردیدند و داده‌های حاصل از طریق مقایسه با اطلاعات بانک ژن مورد بررسی و آنالیز قرار گرفت.یافته‌ها: از بین 21 ایزوله‌ی آسپرژیلوس که تعیین توالی شدند، 7 جدایه به عنوان آسپرژیلوس فلاووس (aspergillus flavus)، 3 جدایه آسپرژیلوس فومیگاتوس (a. fumigates)، 3 جدایه آسپرژیلوس چوالیری (a. chevalieri)، 2 جدایه آسپرژیلوس توبینژنسیس (a. tubingensis)، 2 جدایه آسپرژیلوس نیوئوگلاکوس (a. niveoglacus)، 2 جدایه به عنوان آسپرژیلوس روبر (a. ruber)، یک جدایه آسپرژیلوس نایجر (a. niger) و یک جدایه نیز به عنوان آسپرژیلوس ورسیکالر (a. versicolor) شناسایی شدند. یافته‌های مورفولو‍‍ژی با نتایج ژنوتیپی تایید گردید.نتیجه‌گیری: یافته‌های این مطالعه نشان داد که تعیین توالی ژن بتا توبولین برای شناسایی جدایه‌های محیطی آسپرژیلوس در سطح گونه بسیار با ارزش است و این روش، اعتبار بیشتری در مقایسه با بررسی ریخت شناسی جدایه‌ها دارد. استفاده از دیگر اهداف ژنتیکی و روش‌های مولکولی مبتنی بر dna برای مطالعه‌ی بیشتر گونه‌های آسپرژیلوس توصیه می‌شود.
|
|
کلیدواژه
|
آسپرژیلوس؛ بتا توبولین؛ شناسایی
|
|
آدرس
|
دانشگاه علوم پزشکی تهران, دانشکده بهداشت, گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی تهران, دانشکده بهداشت و موسسه ملی تحقیقات سلامت, گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی تهران, دانشکده بهداشت, گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی اصفهان, دانشکده بهداشت, گروه مهندسی بهداشت محیط, ایران, دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز, دانشکده پزشکی, گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی تهران, دانشکده بهداشت, گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Morphological and Genotypic Identification of Some Environmental Isolates of Aspergillus in Iran Based on BetaTubulin Gene Sequencing
|
|
|
|
|
Authors
|
Shokohi Gholamreza ,Mirhendi Hossein ,Kordbacheh Parivash ,Nikaeen Mahnaz ,Rezaei-Matehkolaei Ali ,Abastabar Mahdi
|
|
Abstract
|
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|