شناسایی ایزوله‌های بالینی مایکوباکتریوم‌های غیر توبرکلوزیس شایع اصفهان با روش pcr-rflp analysis ژن rpob

مقدمه: مطالعه جهت تشخیص جنس مایکوباکتریوم، معیاری را برای بررسی اپیدمیولوژی و پاتوژنز این گروه از باکتری‌ها در نواحی جغرافیایی مختلف فراهم می‌کند. با توجه به شیوع عفونت‌های ناشی از مایکوباکتریوم در ایران و همچنین همسایگی ایران با دو کشور افغانستان و پاکستان که در زمره‌ی 22 کشور high burden دنیا هستند، ضرورت توجه بیش از پیش به این بیماری و ارایه‌ی مولکولار اپیدمیولوژی بیماری‌های مایکوباکتریال روشن می‌گردد. pcr-rflp analysis (pra یا polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism analysis) یک روش دقیق و ارزان می‌باشد که تشخیص گونه‌های‌ مایکوباکتریوم را فراهم می‌‌آورد. این مطالعه با هدف تعیین پروفایل قطعات محدود شونده با استفاده از روش پیش‌گفته برای مشخص نمودن تایپ‌های شایع مایکوباکتریوم‌های غیر توبرکلوزیس اصفهان انجام گردید. روش‌ها: 34 ایزوله‌ی بالینی پس ازگردآوری و کشت توسط روش فنوتیپی تشخیص داده شدند. یک قطعه‌ی bp 360 از ژن rpob با روش pcr (polymerase chain reaction) تکثیر گردید و سپس محصولات pcr تحت تاثیر دو آنزیم mspi (moraxella sp.) و haeiii (haemophilus aegyptius bacteria) قرار گرفتند. قطعات حاصل از هضم توسط آنزیم با استفاده از ژل متافور آگارز 4 درصد الکتروفورز شدند و مورد آنالیز قرار گرفتند. یافته‌ها: در بین 34 گونه ntm (nontuberculous mycobacteria) مورد بررسی تایپ i مایکوباکتریوم فورچئیتوم با فراوانی 82.35 درصد بیشترین نمونه‌ی جدا شده از مجموعه‌ی نمونه‌های بالینی این منطقه بود و پس از آن، مایکوباکتریوم کانزاسی تایپ i و مایکوباکتریوم گوردونه تایپ i هر دو با 5.88 درصد و مایکوباکتریوم گوردونه‌ی تایپ ii و مایکوباکتریوم اینتراسلولار با 2.94 درصد جدا گردیدند. نتیجه‌گیری: روش pra rpob gene به کار گرفته شده جهت تشخیص گونه‌های مایکوباکتریوم، نتایج معتبری را با توجه به نتایج دیگر مطالعات، در این منطقه‌ی جغرافیایی ارایه نمود. الگوی pra گونه‌های‌ مایکوباکتریوم‌ کانزاسی‌ ساب تایپ i (60.175/30.40 mspi:، 90.205 heaiii:) و مایکوباکتریوم اویوم (80.105/40 mspi:، 270 heaiii:) حاصل از این مطالعه با الگوی به دست آمده از بعضی مطالعات، یکسان بود؛ اما با پروفایل تعدادی دیگر همسان نبود. این روش، توانست 100 درصد ایزوله‌های مایکوباکتریوم غیر توبرکلوزیس را شناسایی کند.