طراحی روش جدید محاسبه‌ی پهنای متوسط لاین در تصاویر پالس فیلد ژل الکتروفورز جهت آشکارسازی و استخراج لاین

مقدمه: مقاله‌ی حاضر روش جدیدی را برای محاسبه‌ی پهنای متوسط لاین در تصاویر پالس فیلد ژل الکتروفورز (pulsed field gel electrophoresis یا pfge) جهت آشکارسازی و استخراج لاین‌ها نشان داد. اگرچه مطالعاتی پیرامون آشکارسازی لاین‌ها بر اساس پروجکشن- پروفایل ‏(‏projection profiles‏) ‏گزارش شده، اما هنوز یک روش اتوماتیک با خطای کم انجام نگرفته است. پهنای متوسط لاین، مهم‌ترین پارامتر برای انجام اتوماتیک پردازش تصاویر pfge می‌باشد. این پژوهش با هدف استفاده از روش چگالی طیف توان برای محاسبه‌ی پهنای متوسط لاین انجام شد. روش‌ها: ابتدا بر اساس چگالی طیف توان، پردازش تصاویر pfge انجام گردید. الگوریتم پیشنهادی با استفاده از 10 تصویر pfge بهبود داده شد و سپس برای تست از 20 تصویر دیگر استفاده گردید که در مجموع شامل 300 لاین بود. تصاویر با استفاده از دستگاه ژل الکتروفورز میدان پالسی مدل bio-rad واقع در آزمایشگاه میکروب‌شناسی دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه تهیه شد. یافته‌ها: استفاده از روش چگالی طیف توان در مقایسه با روش تقاطع خط افقی، 99/6 درصد از خطای آشکارسازی مراکز لاین را کاهش می‌دهد. نتیجه‌گیری: با توجه به این ‌که پارامتر پهنای متوسط لاین در چندین مرحله برای آشکارسازی و استخراج لاین‌ها مورد استفاده قرار گرفت، استفاده از روش چگالی طیف توان می‌تواند فرایند استخراج لاین را بهبود بخشد.