|
|
نسل جدید روش های توالی یابی و کاربردهای آن
|
|
|
|
|
نویسنده
|
مصلایی میثم ,میرزایی حامد ,سیمونیان میگانوش ,خیرالهی مجید
|
منبع
|
مجله دانشكده پزشكي اصفهان - 1394 - دوره : 33 - شماره : 368 - صفحه:2469 -2480
|
چکیده
|
توالییابی dna یک روش آزمایشگاهی است که برای تعیین توالی یک مولکول dna استفاده میشود و خود شامل هر روش یا تکنولوژی میباشد که برای تعیین ترتیب چهار باز آدنین، گوانین، سیتوزین و تیمین در یک رشتهی dna به کار برده میشود. توالییابی dna، ممکن است برای تعیین توالی ژنهای ویژه، مناطق بزرگ ژنومی، کل کروموزوم و کل ژنوم به کار برده شود. امروزه، با پیشرفتهای قابل ملاحظهای که در بیولوژی مولکولی به وجود آمده است، روشهای سنتی توالییابی (به طور عمده تکنیک sanger) که زمانبر و گران میباشند، دیگر پاسخگوی نیاز محققان نیستند. در نتیجه، افزایش تقاضا برای کاهش هزینهی توالییابی، به توسعهی تکنولوژیهای توالییابی با توان عملکردی بالا (نسل جدید توالییابی) منجر شد که قادر به توالییابی هزاران و یا میلیونها توالی به صورت همزمان میباشد. نسل جدید توالییابی، قادر به توالییابی سریع قطعات بزرگ dna در طول ژنوم است و با حداقل ابزارها، قادر به تولید گیگا باز داده در هر مرحلهی توالییابی میباشد. روشهای نسل جدید توالییابی، طیف وسیعی از کاربردها نظیر توالییابی کل ژنوم، توالییابی از نو، توالییابی rna برای کاربردهایی مثل بررسی ترانسکریپتوم و rnaهای کوچک، بررسی متیلاسیون و بررسی برهمکنش نوکلئیک اسید و پروتئین را شامل میشوند.
|
کلیدواژه
|
توالی یابی، نسل جدید توالی یابی، تکنولوژی 454، تکنولوژی، Sequencing by oligonucleotide ligation and detection 5Solex
|
آدرس
|
دانشگاه علوم پزشکی اصفهان, دانشکده ی پزشکی، پژوهشکده پیش گیری اولیه از بیماری های غیر واگیر، مرکز تحقیقات بیماری های ارثی کودکان, گروه ژنتیک و بیولوژی مولکولی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی مشهد, مرکز تحقیقات بیولوژی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی اصفهان, دانشکده ی پزشکی، پژوهشکده پیش گیری اولیه از بیماری های غیر واگیر، مرکز تحقیقات بیماری های ارثی کودکان, گروه ژنتیک و بیولوژی مولکولی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی اصفهان, دانشکده ی پزشکی، پژوهشکده پیش گیری اولیه از بیماری های غیر واگیر، مرکز تحقیقات بیماری های ارثی کودکان, گروه ژنتیک و بیولوژی مولکولی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
mkheirollahi@med.mui.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NextGeneration Sequencing and its Applications
|
|
|
Authors
|
Mosallayi Meysam ,Mirzaei Hamed ,Simonian Miganoosh ,Kheirollahi Majid
|
Abstract
|
<div><p>DNA sequencing is an approach exploited to determine the sequence of a DNA molecule. It includes any method or technology used to identify and determine the order of the four bases of adenine, guanine, cytosine, and thymine in a strand of DNA. DNA sequencing might be used to determine the sequence of individual genes, larger genetic regions, full chromosomes, or entire genomes. Traditional sequencing methods are mainly based on the original Sanger sequencing technique which makes them very expensive and lowthroughput; thus, they do not meet the needs of researchers. Consequently, with the considerable advances in molecular biology and the high demand for lowcost sequencing has encouraged the development of highthroughput sequencing (or nextgeneration sequencing) technologies that parallelize the sequencing process, producing thousands or millions of sequences concurrently. Nextgeneration sequencing enable us to rapidly sequence a large piece of DNA which could span the whole genome with the latest instruments capable of producing gigabases of data in one isolated sequencing run. Nextgeneration sequencing platforms have a wide variety of applications, such as wholegenome sequencing, de novo sequencing, RNA sequencing (for applications such as transcriptomics and small RNA analysis), methylation analysis, and proteinnucleic acid interaction analysis.</p></div>
|
Keywords
|
Sequencing ,Nextgeneration sequencing ,454 ,Solex ,Sequencing by oligonucleotide ligation and detection (SOLiD)
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|