تعیین ژنوتایپ گونه‌های مایکوباکتریوم غیر توبرکلوزیس موجود در نمونه‌های شیر دام‌های اصفهان به روش تعیین توالی ژن 16s rrna

مقدمه: مایکوباکتریوم‌های غیر توبرکلوزیس (ntm یا nontuberculous mycobacteria)، از مهم‌ترین باکتری‌هایی هستند که می‌توانند از شیر گاو و فراورده‌های آن به انسان منتقل شوند. حضور این باکتری‌ها در شیر گاو، به عنوان یک نگرانی در عرصه‌ی بهداشت عمومی، به ویژه در میان افرادی که شیر خام و فراورده‌های لبنی حاصل از آن را مصرف می‌کنند، محسوب می‌شود. در این مطالعه، به منظور بررسی میزان شیوع مایکوباکتریوم‌های غیر توبرکلوزیس و تعیین انواع آن در نمونه‌های شیر دام‌های استان اصفهان، از روش تعیین توالی ژن 16s rrna استفاده گردید.روش‌ها:از ایزوله‌هایی که به عنوان مایکوباکتریوم غیر توبرکلوزیس شناسایی شد، استخراج dna با روش cetyltrimethylammonium bromide (ctab) و فنل کلروفورم صورت گرفت. سپس، واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (pcr یا polymerase chain reaction) ژن 16s rrna با استفاده از پرایمرهای طراحی شده انجام و پس از تعیین توالی، انواع این باکتری تعیین شدند. یافته‌ها: از 119 نمونه‌ی شیر جمع‌آوری شده از گاوداری‌های استان اصفهان، تعداد 9 کشت مثبت شناسایی شد که 8 مورد آن و یک مورد آن gordonae. m بود. نتیجه‌گیری: شیوع ntm در نمونه‌های شیر گاو بررسی شده در استان اصفهان 8.6 درصد بود که پس از pcr با ژن 16s rrna و تعیین توالی، فروانی ایزوله‌ی m. fortuitum نوع 88.9 درصد و فراوانی ایزوله‌ی gordonae نوع 11.1 درصد بود. روش pcr و تعیین توالی ژن 16s rrna به کار گرفته شده در این مطالعه، توانایی تشخیص 100 درصد ایزوله‌های مایکوباکتریوم را دارا بود.