خوشه بندی بیانی پروتیین های هیپوکامپ موش صحرایی سالم و آلزایمر در حضور عصاره آبی اسطوخودوس

چکیده مقدمه: یکی از میان برهای کشف هدف های دارویی بهره گیری از دانش های جدیدی علوم پایه پزشکی نظیر ژنومیکس، پروتیومیکس، متابولومیکس، آمار زیستی و بیوانفورماتیک می باشد که به صورت جامع نگر به مطالعه مباحث بیولوژیک و پزشکی می پردازد. در این مطالعه با کمک دانش پروتیومیکس و استفاده از بیوانفورماتیک و آمار زیستی به شناسایی هدف های پروتیینی دارویی برای درمان آلزایمر پرداخته می شود. پروتیوم هیپوکامپ موش های آلزایمری و سالمی که تحت تاثیر عصاره آبی گیاه اسطخودوس قرار گرفته اند مورد خوشه بندی از نظر میزان بیان قرار می گیرند. مواد و روش ها: استخراج پروتیین از نمونه مغز موش سالم(c) : استخراج پروتیین از نمونه مغز موش سالم(c) و آلزایمری(a) که عصاره دریافت نکرده اند و سالم(ce) و آلزایمری(ae) که تحت انکوباسیون با عصاره بوده اند صورت گرفت و با استفاده از الکتروفورز دوبعدی جداسازی پروتیین ها انجام شد. سپس ژل ها جهت رویت لکه های پروتیینی به روش نیترات نقره رنگ آمیزی شد. پروتیین های چهار گروه با نرم افزار بیوانفورماتیکی مورد آنالیز بیوانفورماتیکی و آماری قرار گرفت یافته های پژوهش: آنالیز بیوانفورتیکی و آماری ژل های به دست آمده از تکنیک الکتروفورز دو بعدی نشان داد که 990 نقطه پروتیینی در چهار گروه مشاهده شد مقایسه پروتیوم a و ae، 49 پروتیین در گروه a وجود داشت که در گروه ae بیانی نداشتند در حالی که 26 نقطه در گروه ae وجود دارد که دارای بیان جدید هستند و ناشی از اثر عصاره است. مقایسه پروتیوم دو گروه c و ce نشان داد که حضور عصاره باعث بیان 80 پروتیین جدید و خاموشی 104 پروتیین شده است بحث و نتیجه گیری: بعد از حذف پروتیین های مشترک بین دو گروهی که تحت تاثیر عصاره بودند پروتیین هایی که در واقع نقش کاندید دارویی برای درمان آلزایمر هستند مشخص شد. تغییرات در سطح ملکولی با آنالیزهای آماری چند متغیره ای نظیر کلاسترینگ یا آنالیز همبستگی و آنالیز مولفه اصلی به خوبی آشکار گردید و گروه های پروتیینی که دارای تغییر بیان بودند در 3 خوشه اصلی معرفی گردید. در نهایت می توان نتیجه گرفت که عصاره اسطوخودوس باعث تغییر بیان معنی داری در سطح پروتیوم می شود و احتمالا فرایند های بیولوژیک ویژه ای را در هیپوکامپ موش صحرایی فعال می نماید که در همراهی با تقویت یادگیری و حافظه در موش سالم و آلزایمری می گردد.