مطالعۀ ارتباط پلی‌مورفیسم rs13476 در ژن کدکنندۀ lncrna gas5 با بروز دیابت نوع دو در جمعیت اصفهان

مقدمه: gas5 lncrna یک rna طویل غیر کدشونده است و در تنظیم بیان ژن‌ها نقش دارد. مطالعات نشان داده‌اند که بیان lncrna gas5 در سرم بیماران دیابتی کاهش می‌یابد. با توجه به نقش lncrna gas5، هدف پژوهش حاضر بررسی ارتباط بین پلی‌مورفیسم rs13476 در ژن کدکنندۀ این lncrna با بروز دیابت نوع دو در جمعیت اصفهان است.مواد و روش‌ها: در این پژوهش موردشاهدی، 200 فرد سالم و 200 فرد بیمار دیابتی نوع دو به‌طور تصادفی، از جمعیت مدنظر انتخاب شدند. ژنوتیپ افراد برای پلی‌مورفیسم مدنظر، با روش pcr_rflp تعیین و برای تایید نتایج، تعدادی از نمونه‌ها سکانس گردید؛ سپس فراوانی ژنوتیپ‌ها و به دنبال آن، فراوانی آلل‌ها به‌منظور به دست آوردن ارتباط این پلی‌مورفیسم با خطر ابتلا به دیابت نوع دو، جنس و بروز بیماری آنالیز شد.یافته‌های پژوهش: پس از تکثیر قطعۀ 380 جفت‌بازی حاوی پلی‌مورفیسم rs13476 در همۀ نمونه‌ها و سپس هضم آنزیمی آن‌ها توسط آنزیم bcci، همۀ نمونه‌ها ژنوتیپ tt را نشان دادند. نتایج سکانس تعدادی از نمونه‌ها نیز، نتایج هضم آنزیمی را تایید کردند. فراوانی ژنوتیپ tt در جمعیت یادشده، 400 مورد (100 درصد) و فراوانی آلل t، 800 مورد گزارش شد و آلل a در جمعیت یادشده مشاهده نگردید.بحث و نتیجه‌گیری: با توجه به نبودِ ارتباط پلی‌مورفیسم مدنظر با خطر ابتلا به دیابت در این جمعیت، از این پلی‌مورفیسم نمی‌توان برای غربالگری بیماران دیابتی در جمعیت مدنظر استفاده کرد. مطالعات بیشتر در زمینۀ ارزیابی اهمیت پلی‌مورفیسم مطالعه‌شده در جمعیت‌های گوناگون ضروری است.

Association of Rs13476 Polymorphism in lncRNA GAS5 Encoding Gene with Type 2 Diabetes in Isfahan, Iran

Introduction: Gas5 lncRNA is a long noncoded RNA that is involved in regulating gene expression. Studies have shown that the expression of GAS5 lncRNA is reduced in the serum of diabetic patients. Considering the role of GAS5 lncRNA, the present study aimed to investigate the association between rs13476 polymorphism in the gene encoding this lncRNA with the incidence of type 2 diabetes in Isfahan, Iran. Materials Methods: This casecontrol study was conducted on 200 healthy individuals and 200 patients with type 2 diabetes who were randomly selected from the target population. The individuals #39; genotypes were determined for the polymorphism using the PCRRFLP method, and some samples were sequenced to confirm the results. Afterward, the frequency of genotypes, and consequently, the frequency of alleles was analyzed in order to obtain the relationship of this polymorphism with risk of type 2 diabetes, gender, and disease incidence.Ethics code: IR.IAU.SHK.REC.1398.021 Findings: After amplification of 380 bp fragment containing rs13476 polymorphism in all samples and then enzymatic digestion by BCCI, all samples showed TT genotype. Moreover, the sequence results of a number of samples confirmed the results of enzymatic digestion. The frequency of TT genotype in the target population was 400 cases (100%), and the frequency of T allele was 800 cases. On the other hand, allele A was not observed in the target population. Discussions Conclusions: Due to the lack of association between polymorphism and risk of diabetes in this population, this polymorphism cannot be used to screen diabetic patients in Isfahan, Iran. Further studies are required to evaluate the importance of polymorphism studied in different populations.