بررسی تنوع ژنتیکی پروتئوس میرابیلیس جدا شده‎ ‎از نمونه های ادراری توسط روش ‌box pcr

مقدمه: پروتئوس میرابیلیس یکی از عوامل شایع در عفونت های مجرا ادراری( uti ) می باشد. روش های متعدد مولکولی جهت ژنوتایپینگ باکتری ها به کار می رود. روش واکنش زنجیره ای پلیمراز مبتنی بر توالی های تکرار شونده با استفاده از مجموعه پرایمرهای boxa1r جهت افتراق و تفکیک باکتری های استفاده شده است. هدف از مطالعه حاضر ارزیابی تنوع ژنتیکی ایزوله های پروتئوس میرابیلیس جدا شده از نمونه ادراری می باشد. مواد و روش ها: در این مطالعه توصیفیمقطعی، 60 ایزوله پروتئوس میرابیلیس از نمونه ادرار با استفاده از تست های بیوشیمیایی شناسایی شد. dna نمونه ها استخراج و آزمایش boxpcr صورت گرفت. یافته های پژوهش: نمودار درختی یا دندوگرام آزمون boxpcr ترسیم شد و نتایج نشان داده شد که تمامی سویه ها در سطح تشابه 57 درصد به 7 کلاستر مجزا تفکیک شدند. در گروه اول سه ایزوله، 9 ایزوه در گروه دوم، در گروه سوم 18 ایزوله، 2 ایزوله در گروه چهارم، 11 ایزوله در گروه پنجم، یک ایزوله در گروه ششم و 16 ایزوله در گروه هفتم قرار گرفتند. آنالیز دندوگرام مشخص نمود که سویه های متعلق به یک سرووار از یکدیگر قابل تفریق هستند. بحث و نتیجه گیری: این روش نشان داد که انگشت نگاری مولکولی با پرایمر lrm; boxa1r جهت تایپینگ جدایه های باکتری ها از منشاء متفاوت و مختلف مفید می باشد. هم چنین دارای قدرت تفریق و تمایز بسیار مناسب، استفاده مطلوب در مطالعات اپیدمیولوژی و ردیابی منبع عفونت و تاکسونومی هستند.

Genetic Diversity of Proteus Mirabilis Isolated from Urine Specimens by Box PCR

Introduction: Proteus mirabilis is one of the common causes of UTI.Multiple molecular methods are used to genotype bacteria.The polymerase chain reaction method is based on repeated sequences using BOXA1R primers for differentiation of bacteria. This study aimed to evaluate the genetic lrm;diversity of protease mirabilis isolated from urine specimens. Materials Methods: In this descriptive crosssectional study, 60 isolates protease mirabilis were lrm;identified from urine specimens using biochemical tests. DNA samples were extracted and tested for BOXPCR. Findings: The tree diagram or dendrogram of BOXPCR was drawn and the results showed that all strains were lrm;segregated into 7 separate clusters at a similarity level of 57% lrm;. There were three isolates in the first group, nine in the second group, 18 in the third group, two lrm; in the fourth group, 11 in the fifth group, one in the sixth group, and 16 isolates lrm;in the seventh group. lrm; Dandrogram analysis revealed that the strains belonging to a serovar are subtracted from each other. lrm; Discussion Conclusions: This method demonstrated that molecular fingerprinting with BOXA1R primers is useful for typing bacterial lrm;isolates from different origins. lrm; Moreover, it has a really efficient differentiation power, it can be used effectively in epidemiological studies, and lrm;trace source of infection and taxonomy. lrm;