آنالیز آماری بیان آنتی‌ژن mage-a4 در سرطان‌های وابسته و پیش بینی عرضه آنتی‌ژن با مولکول hla-b37 مبتنی بر روش‌های بیوانفورماتیکی

زمینه و هدف: ایمونوتوکسین ها از جمله راهبردهای امیدوار کننده در درمان هدفمند سلول های سرطانی هستند که با مکانیسم اتصال اختصاصی به آنتی ژن های توموری عمل می کنند. لذا واکاوی این نوع از آنتی ژن ها و پایش ویژگی های ساختاری و عمکردی آن ها فراهم کننده بستری در ارتباط با توسعه این نوع از داروها می باشد. در این تحقیق، مطالعه خانواده آنتی ژنی mage بر اساس آزمون های بیوانفورماتیکی در دستور کار قرار گرفته است.روش کار: در گام نخست، آنالیزآماری بیان آنتی ژن های خانواده mage در انواع سرطان ها با استفاده از برنامه spssانجام گرفت. بعد از تعیین magea4 به عنوان آنتی ژن برتر، براساس مرور منابع، اپی توپ های اتصالی magea4 با ایزوفرم های مختلف hlaشناسایی شد. سپس با استفاده از برنامه های bimas و syfpeithi اپی توپ های اتصالی گزارش شده در منابع تائید شد. شاخص پایداری و ایمونوژنسیتی اپی توپ ها به ترتیب با استفاده از برنامه های protpram وiedb انجام شد. به منظورتعیین میل اتصالی و پایداری کمپلکس hla-b37-peptide درشرایط شبه واقعی، نرم افزارهای اتوداک وینا وگرومکس 5.1 مورداستفاده قرارگرفت. یافته ها: نتایج حاصل از این آزمون منجر به آشکارسازی میزان و گستره بیانی بالای magea4 در مقایسه باسایر اعضای این خانواده شد. همچنین پپتید vdelahfllمشتق شده ازmagea4 با بالاترین میزان پایداری وایمونوژنسیتی مطلوب آشکارشد. از سوی دیگر کمپلکس hlab37vdelahfll با پایین ترین میزان نمودار rmsd به عنوان پایدارترین کمپلکس ارزیابی گردید.نتیجه گیری: به طورکلی نتایج حاصل از این تحقیق نشان دادکه پپتید مورد نظر vdelahfll از آنتی ژن magea4 ممکن است در تولید آنتی بادی مونوکلونال وتوسعه واکسن در درمان مدرن سرطان مدنظر قرارگیرد.