تعیین اپی توپ های ناپیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونولوژی محاسبه ای

زمینه و هدف: ایمونوگلوبولین ها(igs) گروهی از پروتئین های سرم هستند که نقش مهمی در دفاع علیه میکروارگانیسم ها بر عهده دارند. ایمونوگلوبولین ها از زنجیره های سبک و سنگین تشکیل شده اند. زنجیره های سبک بر اساس تفاوت در انتهای کربوکسیلی ناحیه ثابت خود به دو ایزوتیپ کاپا (κ) و لامبدا (λ) تقسیم می شوند. تغییرات قابل توجهی در نسبت زنجیره های کاپا به لامبدا می تواند در گسترش منوکلونال لنفوسیت های b در بدخیمی سلول های b یا در عفونت با ویروس ایدز در دوران جنینی روی دهد. به منظور سنجش دقیق یا هدف گیری اختصاصی زنجیره های سبک برای اهداف درمانی، ابزارهایی شناسایی اختصاصی دارای حساسیت و ویژگی بالا از جمله آنتی بادی های منوکلونال مورد نیاز هستند. در این راستا تعیین دقیق اپی توپ های اختصاصی زنجیره های سبک حائز اهمیت خاصی است. ایمونولوژی محاسبه ای شاخه ای از علم ایمونولوژی است که با به کارگیری اطلاعات زیستی موجود در کامپیوتر به تشخیص دقیق تر بیماری ها کمک می کند. هدف مطالعه حاضر بررسی و تعیین اپی توپ های ناپیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونولوژی محاسبه ای می باشد. روش کار: توالی اسیدهای امینه و ساختار سوم زنجیره سبک ایمونوگلوبولین g مرجع انسان در پایگاه اطلاعاتی pdb (protein data bank)، ساختار دوم زنجیره سبک ایمونوگلوبولین توسط نرم افزار phyre2 (protein homology/analogy recognition engine v 2.0) و اپی توپ های ناپیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین g مرجع انسان توسط نرم افزار cep تعیین شدند.یافته ها: در این مطالعه 5 اپی توپ ناپیوسته در دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین g انسان توسط نرم افزار cep شناسایی شد. اپی توپ های فوق الذکر درناحیه قرارگیری اسیدهای آمینه شماره 100 الی 214 واقع شده اند. نتیجه گیری: در این پژوهش تعدادی از اپی توپ های ناپیوسته دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین g انسان شناسایی شدند. این اپی توپ ها ابزارهای بسیار ارزشمندی جهت تولید آنتی بادی های مونوکلونال اختصاصی زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان بوده و می توانند به طور بالقوه برای تولید کیت های تشخیص اختصاصی زنجیره سبک، درمان برخی از بدخیمی های لنفوسیت b، تعیین نقشه اپی توپ های زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان و مطالعات تکاملی مفید باشند.