غربالگری بیوانفورماتیکی مهارکننده‌(های) پروتئاز ns3/4a ویروس هپاتیت سی از دو گیاه دارویی cornus officinalis و syzygium aromaticum

زمینه و هدف: عفونت ناشی از ویروس هپاتیت سی یکی از معضلات مهم پیش روی سلامت عمومی ویکی از عوامل اصلی مرگ و میر در جهان است. بنابراین اخیرا پژوهش های زیادی با هدف معرفی ترکیبات جدید و موثر ضد هپاتیت سی بویژه ترکیبات گیاهی انجام شده است. هدف از پژوهش حاضر غربالگری بیوانفورماتیکی مهارکننده (های) پروتئاز ویروس هپاتیت سی از دو گیاه دارویی cornus officinalis و syzygium aromaticum می باشد.روش کار: ابتدا ساختار سه بعدی پروتئاز ویروس هپاتیت سی و ترکیبات غالب گیاهان مذکور به ترتیب از پایگاه داده های پروتئین وpubchem دریافت شد. سپس خصوصیات فیزیکوشیمیایی ترکیبات گیاهی و پتانسیل سمیت سلولی و جهش زایی آن ها با استفاده از نرم افزارهایswiss adme و toxtree پیش بینی شد. در نهایت ترکیبات گیاهی و پروتئاز هپاتیت سی در بررسی داکینگ مولکولی با استفاده از نرم افزار igemdock 2.1 مورد مطالعه قرار گرفتند.یافته ها: نتایج نشان داد که ترکیبات مورد بررسی فاقد پتانسیل جهش زایی و سمیت سلولی هستند. نتایج بدست آمده حاکی از برهمکنش های قوی و مناسب ترکیبات مورد مطالعه با آنزیم ns3/4a خصوصا در ناحیه ی مسئول فعالیت پروتئازی است. افزون بر این مشخص شد که 1,2,6trigalloylglucose،hyperoside، isoquercitrin، rhamnetin، ursolic acid و methyl salicylate برهمکنش های قوی تری را با اسیدآمینه های کلیدی جایگاه فعال آنزیم ایجاد می کنند. نتیجه گیری: بر اساس نتایج حاصل شده می توان نتیجه گرفت که ترکیبات گیاهی مورد بررسی می توانند به عنوان نامزد های مناسبی جهت بررسی های برون و درون تنی به منظور دستیابی به ترکیبات ضد هپاتیت سی مورد ارزیابی قرار گیرند.