شناسایی مولکولی پاتوتایپ اشریشیاکلی انتروپاتوژن (epec) با تکنیک واکنش زنجیره ای پلیمراز(pcr) در کودکان زیر 5 سال شهر تهران و بررسی مقاومت آنتی بیوتیکی آنها

زمینه وهدف: باکتری اشریشیاکلی انتروپاتوژن (epec enteropathigenic e.coli) از خانواده انتروباکتریاسه و بعنوان یک عامل مهم گاستروانتریت و اسهال بویژه در کودکان کشورهای در حال توسعه و نیز توسعه نیافته می باشد. این پاتوتایپ می تواند در کودکان زیر 5 سال سبب بیماری شدید و یا حتی مرگ شود. تعیین الگوی توزیع این پاتوتایپ ها در نواحی جغرافیایی مختلف و بررسی مقاومت آنتی بیوتیکی آنها به منظور تجویز مناسب آنتی بیوتیک ها اهمیت زیادی دارد. این مطالعه با هدف بررسی شیوع پاتوتایپ epec عامل اسهال در کودکان زیر 5 سال شهر تهران و تعیین الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی آنها انجام گرفت.روش کار: 300 نمونه اسهال کودکان زیر 5 سال از بیمارستان کودکان تهران جمع آوری و با استفاده از تستهای بیوشیمیایی استاندارد به عنوان کشت برروی محیط های انتخابی و تست های بیوشیمیایی، گونه های اشریشیاکلی شناسایی شدند. تمامی ایزوله ها اشریشیاکلی های جدا شده به منظور بررسی وجود ژن اینتیمین (eaea) با تکنیک واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr) مورد ارزیابی قرار گرفتند. تعیین مقاومت آنتی بیوتیکی پاتوتایپ های حاوی ژن eaea به کمک تست آنتی بیوگرام در مورد 16 آنتی بیوتیک به روش انتشار در دیسک صورت گرفت. برای تحلیل داده ها از روش های آمار توصیفی استفاده شد.یافته ها: از تمام نمونه های اخذ شده از بیماران، 36 مورد (12%) epec با تکنیک pcr مورد تایید واقع شد. بیشتر پاتوتیپ های epec جدا شده 22 مورد(61.1%) (62%) مربوط به کودکان زیر 1 سال بودند. تمام 36 پاتوتایپ های جدا شده نسبت به آنتی بیوتیک های ایمی پنم و مروپنم حساس بودند. بیشترین میزان مقاومت پاتوتایپ ها نسبت به آنتی بیوتیک های تتراسایکلین و آموکسی سیلین23 مورد(63.9%) (64%) بود. همچنین 24 ایزوله (66.7%) (67%) الگوی مقاومت چندگانه به آنتی بیوتیک های رایج را نشان دادند.نتیجه گیری: پاتوتایپ های epec در ایران به عنوان عامل اسهال کودکان مطرح هستند که بایستی جهت شناسایی آنها از تکنیک های نوین و معتبر بهره گرفت.

Identification of enteropathogenic E.coli (EPEC) pathotype using PCR technique in under 5- years old children in Tehran and evaluation of their antibiotic resistance patterns

Background: Enteropathogenic E.coli (EPEC) pathotypes are belonging to enterobacteriaceae family that is known as agent of gastroenteritis and diarrhea in under 5 year old children. These bacteria have high prevalence in developed and developing countries that may cause severe diarrhea even death. Prevalence and antibiotic resistance patterns of these pathotypes are different in various regions and are dependent on many factors. Awareness of the patterns is necessary for physicians in order to treat infections. This research is aimed to identify of EPEC pathotypes in diarrheal fewer than 5 years old children and study the patterns of antibiotic resistance of these strains in Tehran.Methods: 300 samples were collected from children with diarrhea visited in children Hospital in Tehran. Bacterial isolates confirmed as E.coli species on the basis of standard bacterial and biochemical tests. All isolates E.coli species were subjected to polymerase chain reaction (PCR) for detection of eaeA (intimin) gene in terms of EPEC pathotypes. Then, antibiogram test for EPEC pathotypes was performed using 16 different antibiotic disces by disc diffusion agar (KirbyBauer) method.Results: Among all specimens, 36(12%) isolates bearing eaeA gene were confirmed as EPEC using PCR. 22 specimens(61.1%) 62% of identified pathotypes were isolated from under 1 year old children. All pathotypes were sensitive to imipenem and meropenem. Antibiotic resistance toward amoxicillin and tetracycline23(63.9%) (64%) was higher than others. Also 24 isolates(66.7%) (67%) showed multiresistant pattern toward several routine antibiotics.Conclusion: Since EPEC pathotypes are diagnosed as agent of diarrhea in children in our country, identification of these pathotypes showed be made through novel techniques. Antibiotic resistance of EPEC pathotypes toward classic antibiotics including tetracycline and amoxicillin is increasing. Evaluation and detection of antibiotic resistance pattern of these pathotypes is very important for effective treatment and decreasing of resistance toward antibiotics