|
|
|
|
بررسی جهش در اگزون 7 ژن اکسین 2 در سرطان کولورکتال (مطالعات آزمایشگاهی و بیوانفورماتیکی)
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
جلالی فر عطیه ,محمد گنجی شهلا ,مینوچهر زرین ,خانیکی محمود ,عباس زاده موخر بهروز
|
|
منبع
|
مطالعات علوم پزشكي - 1397 - دوره : 29 - شماره : 4 - صفحه:264 -269
|
|
چکیده
|
پیش زمینه و هدف: سرطان کولون و رکتوم (colorectal cancer)در ایران سومین سرطان شایع محسوب می شود. تغییر در مسیر پیام رسانی wnt به صورت رایج در این سرطان گزارش شده است. از فعالیت های مهم این مسیر می توان به نقش در سرطان زایی، تکثیر سلولی، مهاجرت سلولی و... اشاره کرد. اکسین 2 (axin2) به عنوان یک تنظیم کننده منفی (negative regulator) در مسیر پیام رسانیwnt/tcf فعالیت کرده و در شکل گیری کمپلکس تخریب بتاکاتنین کمک می کند؛ تحقیقات انجام گرفته نشان داده است که این پروتئین در بسیاری از موارد ابتلا به سرطان crc دچار جهش شده است. هدف این پروژه مطالعه روی snp با شناسه rs370618491 نوکلئوتید t2140c در اگزون7 ژن اکسین2 و بررسی نقش احتمالی جهش در این snp در سرطان کلورکتال است.مواد و روش کار: در این پروژه 147نمونه خون و بافت توموری فریز شده و 25 نمونه شاهد و همچنین 3 رده سلولی سرطان کولورکتال 29ht، 480 sw و 2caco استفاده شده است. انتخاب snp به کمک روش های بیوانفورماتیکی ازجمله استفاده از پایگاه اطلاعات ncbi و ensemblو ابزار polyphen انجام شده است، استخراج dna به روش فنولکلروفرم انجام شده و روش آزمایشگاهی pcrrflp استفاده شده است؛ آنالیز آماری اطلاعات دموگرافی و کلینیکی بیماران نیز به کمک نرم افزار spss موردبررسی قرار گرفته است .یافته ها: در 1 نمونه از 147 نمونه بیمار (0.68 درصد)، جهش در جایگاه snp موردنظر مشاهده شد و در سایر نمونه ها ازجمله رده های سلولی موردبررسی جهشی مشاهده نشد. نتایج تحلیل spss نشان داد که در این مطالعه سایز تومور(t) با 0.016 p= و درجه انتشار تومور به غدد لنفاوی (n) با 0.001p= با درجه پیشرفت بیماری(grade) ارتباط معنی دار دارد.بحث و نتیجه گیری: فراوانی این snp در جمعیت ایرانی پایین است؛ بنابراین علی رغم اهمیت اگزون7 ژن اکسین2 در بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال، نتایج آزمایشگاهی هم سو با نتایج مطالعاتی نبود. برخی عوامل ازجمله تنوع بالا در عوامل موثر در ابتلا به سرطان کولورکتال و تنوع ژنتیکی بالا در جمعیت ایرانی می تواند در این زمینه تاثیرگذار باشد. با توجه به اهمیت اکسین2 در مسیر wnt و میزان بالای جهش های مشاهده شده در مطالعات گذشته، بررسی میزان بیان ژن اکسین2 و همچنین کیفیت عملکرد پروتئین آن می تواند در مطالعات آینده حائز اهمیت بوده و موردتوجه قرار گیرد.
|
|
کلیدواژه
|
اکسین 2، اگزون 7، snp، سرطان کولون و رکتوم، rflp
|
|
آدرس
|
پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری, ایران, پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری, ایران, پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری, ایران, دانشگاه علوم پزشکی تهران, ایران, دانشگاه صنعتی مالک اشتر, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Study of mutation in exon 7 of axin 2 in colorectal cancer (Laboratory and bioinformatics studies)
|
|
|
|
|
Authors
|
jalalifar atiye ,mohammad ganji shahla ,minuchehr zarrin ,khaniki mahmood ,abbaszade moakher behrooz
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|