>
Fa   |   Ar   |   En
   بهبود تخصیص‌اعتبار قوانین در سیستم دسته‌‌بندیادگیر با یادگیری تقویتی مارکوف برای پیش‌‌بینی ساختار دوم پروتئین  
   
نویسنده دهقانی محمودآبادی محمدرضا ,میرزائی کمال ,پیروی فرزاد
منبع پژوهشهاي نظري و كاربردي هوش ماشيني - 1402 - دوره : 1 - شماره : 2 - صفحه:92 -104
چکیده    این پژوهش برای افزایش دقت تخصیص‌ اعتبار قوانین در سیستم دسته‌ بند یادگیر با استفاده از یادگیری تقویتی مارکوف جهت پیش‌ بینی ساختار دوم پروتئین ‌است که یادگیری تقویتی مارکوف در سیستم دسته‌ بند یادگیر، جایگزین الگوریتم bucket brigade ‌شده‌ است. برای آموزش سیستم از مجموعه دادگان protein data bank استفاده‌‌ می‌شود که شامل پروتئین 4l1w با تعداد نمونه 5741 است که 70 درصد برای آموزش و 30 درصد جهت آزمایش استفاده‌ شده‌ است. پس از آموزش سیستم، تعدادی دسته‌ بند(قوانین) باارزش، تولید‌ می‌شود که در مرحله آزمایش از این قوانین برای پیش‌ بینی ساختار دوم پروتئین استفاده‌ خواهد شد. نتایج آزمایش‌ها نشان‌ می‌دهد دقت سیستم دسته‌‌ بند یادگیر با یادگیری تقویتی مارکوف در نوع ساده و توسعه‌ یافته آن، افزایش‌ یافته‌ است. با استفاده از یادگیری تقویتی مارکوف، ارزش‌گذاری به هر قانون بهبود داده‌ می‌شود، به گونه‌ای که دقت سیستم دسته‌بند ساده %82.5 و سیستم دسته‌بند توسعه یافته %85 بهبود یافته‌ است.
کلیدواژه بیوانفورماتیک، ساختار دوم پروتئین، سیستم دسته‌بند یادگیر، یادگیری تقویتی مارکوف
آدرس دانشگاه آزاد اسلامی واحد میبد, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد میبد, گروه مهندسی کامپیوتر, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد مرودشت, گروه مهندسی کامپیوتر, ایران
 
   improving credit assignment in a learning classier system with markov reinforcement learning for protein secondary structure prediction  
   
Authors dehghanimahmoudabadi mohammadreza ,mirzaie kamal ,peyravi farzad
Abstract    in this research, markov reinforcement learning has been used to predict the second structure of the protein to assign the validity of the classifier system and the accuracy of the classifier. markov reinforcement learning is used in the learning cluster system instead of the bucket brigade algorithm. the protein data bank dataset has been used for learning and training the system. 4l1w protein with 5741 samples, 70% for learning and 30% for training. after training the system, a number of valuable rules were produced, which were used in the test phase to predict the second structure of the protein. the results of the experiments showed that the learning of the improved learner classifier system and the improved extended learner classifier increased with markov reinforcement learning. considering that in markov reinforcement learning, the scoring response is improved for each rule or classifier. therefore, a more complete scoring method has been performed and the prediction accuracy of each rule or 85 classifiers has been improved.
Keywords bioinformatics ,protein secondary structure ,learning classifier system ,markov reinforcement learning
 
 

Copyright 2023
Islamic World Science Citation Center
All Rights Reserved