مقایسه روش‌های سریع و کم‌هزینه استخراج rna با کیفیت و کمیت بالا از بافت میوه توت فرنگی (fragaria × ananassa dush.)

در آزمایش های زیست شناسی مولکولی مربوط به گیاهان، جداسازی و استخراج اسیدهای نوکلئیک با کیفیت و کمیت بالا، امری مهم است. بافت های گیاه توت فرنگی و خصوصاً بافت تشکیل‌دهنده میوه آن، غنی از پلی ساکارید ها و ترکیبات پلی فنلی است؛ بنابراین استخراج و جداسازی اسیدهای نوکلئیک از آن دشوار است. در تحقیق حاضر 3 روش استخراجrna کل شامل روش sds-pci، کیت استخراج rna کل و روش sds-edta از بافت میوه رسیده توت‌فرنگی مورد مقایسه قرار گرفتند. جهت ارزیابی کمیت و خلوص rna استخراج‌شده حاصل از این سه روش مذکور، نمونه های استخراج شده به منظور اندازه گیری دو شاخص خلوص نسبت جذب نوری (280a /260 a) و (230 a/260 a) در دستگاه نانودراپ قرار داده شدند و همچنین غلظت نمونه ها مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که بهترین نسبت جذبی (071/0 ± 053/2 = 230a /260 a) و (054/0 ± 086/2 = 280a /260 a) با غلظت rna کل 032/0 ± 25/641 در روش sds-pci به دست آمد. علاوه بر این، جهت ارزیابی یکپارچگی rna استخراج شده از ژل الکتروفورز استفاده گردید .نتیجه ژل الکتروفورز شده rna، نشان ‌دهنده شفاف بودن باندهای s 28 دو برابر باندهای s 18 در روش sds-pci بود. همچنین از بهترین روش استخراج (sds-pci) در مقایسه با دو روش دیگر، ساختcdna انجام شد. نتایج این مطالعه نشان داد که روش sds-pci، روشی آسان، سریع و اقتصادی برای استخراج rna از بافت میوه توت‌فرنگی است.