طبقه‌بندی گیرنده‌های جفت‌شونده با پروتئین جی با استفاده از شبکه عصبی clstm

پروتئین ها ماکروملکول‌هایی هستند، که از پیوند پپتیدی بین آمینو اسید‌ها تشکیل شده‌اند. اکثر اعمال حیاتی ارگان‌های زنده توسط پروتئین‌ها انجام می‌شود، از جمله این اعمال می‌توان کاتالیزور اعمال حیاتی، انتقال مواد بین سلول‌ها و غیره را نام برد. در سال های اخیر با پیشرفت روش‌های توالی‌یابی پروتئین ها، توالی بسیاری از پروتئین‌های جدید که عملکرد آن‌ها مشخص نیست، کشف شده‌اند. گرچه ساختار سوم پروتئین ها جهت کشف عملکرد و خانواده ی هر پروتئین کافی است، اما همیشه اطلاعات ساختاری برای پروتئین‌ها در دسترس نیست. روش های آزمایشگاهی جهت به دست آوردن اطلاعات ساختاری پروتئین‌ها برای تعداد بسیار زیاد پروتئین‌های موجود بسیار هزینه و زمان‌بر است، از این رو روش های مبتنی‌بر توالی از جمله روش‌های یادگیری ماشین و یادگیری عمیق مورد توجه محققان قرار گرفته است. در این مقاله، با استفاده از شبکه‌های عصبی عمیق یک روش جدید برای طبقه‌بندی خانواده های پروتئینی ارایه شده است. در ابتدا داده‌های پروتئین‌ها پیش پردازش شده اند تا برای ورودی شبکه آماده شوند. سپس وابستگی‌های محلی داده‌ها با استفاده از دو لایه از شبکه کانولوشن استخراج شده اند، بردار ویژگی به دست آمده در هر لایه از کانولوشن با استفاده از یک لایه پولینگ مختصر‌سازی شده است و در نهایت برای یادگیری عمیق‌تر داده‌ها از یک شبکه عصبی ریکارنت بهره گرفته شده است. نتایج نهایی بیانگر بهبود این روش نسبت به روش های رقیب در این حیطه می باشند.