بررسی تراکم چندشکلی های تک نوکلئوتیدی (اسنیپ) موثر بر دنبه گوسفند

نژادهای مختلفی از گوسفندان با فنوتیپ مختلف از نظر دنبه، در اثر انتخاب طبیعی و مصنوعی پس از اهلی شدن گوسفند ایجاد شده‌اند. هدف این پژوهش، یافتن بخش‌های مختلف ژنوم گوسفند که بر تشکیل دنبه موثرند می‌باشد. از تراشه های k50 اسنیپ شرکت ایلومینا برای تعیین ژنوتیپ گوسفندان موجود در فاز اول پروژه هپ مپ استفاده شد. فنوتیپ گوسفندان بر اساس بود و نبود دنبه به صورت 0 و 1 کدگذاری شد. رگرسیون خطی برای پی بردن به اسنیپ های موثر بر فنوتیپ به کار گرفته شد و نتایج به صورت –log pvalue در قالب نمودار منهتن ارائه شد. با تصحیح بنفرونی سطح 0.000001 بعنوان سطح معنی داری تعیین شد. تصحیح ساختاری انجام نشد تا تمامی اسنیپهای موثر ولی با اندازه کم بر اساس مدل بینهایت لوکوس با اثر کم دیده شوند. یافته‌های پژوهش حاکی از آن است که کروموزوم های یک، دو و سه بیشترین اسنیپ موثر بر تشکیل دنبه را داشته‌اند. اسنیپهای s03686.1 در کروموزوم 25 و اسنیپ oarx_63571789.1 در کروموزوم 27 تاثیر بیشتری در ایجاد دنبه داشته اند. نتایج این پژوهش می تواند به اصلاح گران برای کنترل اندازه دنبه و به متخصصین پزشکی برای درک مکانیسم رسوب چربی در بدن انسان کمک کند.