آنالیز بیان افتراقی ژنهای بافت جنین زنبورعسل در ساعات پس از تخم گذاری با استفاده از داده‌های ترانسکریپتومیکس

در پژوهش حاضر با هدف مطالعه پروفایل بیان ژن و تعیین ژن‌های شاخص با بیان متفاوت و معنی‎دار به طور مجزا در هر گروه نر و ماده بین سه زیرگروه، شامل ساعات پس از تخم‌گذاری (10الی15ساعت (زیرگروه1)، 20الی45ساعت (زیرگروه2) و 55الی70ساعت پس از تخم گذاری (زیرگروه3)) پس از اخذ و ذخیره داده‌های خام، مراحل آنالیز به ترتیب با استفاده از نرم‌افزارهای fastq-dump، fastqc و trimmomatic، hisat2، samtools و cufflinks انجام شده و در نهایت آنالیز هستی‌شناسی به وسیله پایگاه‌های اطلاعاتی david و ensemble صورت گرفت. طبق نتایج پروفایل بیان ژن، 17786 شناسه ژن مشخص شد، که در نهایت با در نظر گرفتن log2(fold_change)>10 و log2(fold_change)<-10 در گروه ماده‌ها بین زیرگروه‌های1و2، شش ژن، زیرگروه‌های 1و3، 23 ژن و زیرگروه‌های 2و3، 12 ژن شاخص و همچنین در گروه نرها بین زیرگروه‌های 1و2، دو ژن، زیرگروه‌های 1و3، 25 ژن و زیرگروه‌های 2و3، شش ژن شاخص با بیان متفاوت و معنی‌دار شناسایی شد (q_value<0.001). نتایج آنالیز هستی‌شناسی ژن‌های شاخص نشان داد که در گروه نر و ماده‌، ژن‌های شاخص در اجزای ساختاری کوتیکول، فعالیت اندوپپتیداز نوع سرین، اتصال یون روی و کلسیم و بیوسنتز هورمون حشرات نقش دارند.