بررسی نقش خانواده ژنی دهیدرین در گیاه جو( hordeum vulgare)

دهیدرین‏ ها (dhns) متعلق به گروه دوم پروتئین ‏های lea می‌باشند که اعضای آن در اواخر دوره جنین‏ زایی در بذر و در پاسخ به تنش‏ های غیرزیستی مانند شوری، خشکی و سرما در بافت رویشی تجمع می‏ یابند. در این مطالعه، 13 ژن کدکننده پروتئین دهیدرین (dhn) در ژنوم جو( hordeum vulgare) شناسایی و خصوصیات فیزیک وشیمیایی، جایگاه سلولی، موتیف‌های حفاظت‌شده و ساختار ژنی آن‌ها تعیین و روابط فیلوژنتیکی بین این پروتئین‌ها مد نظر قرار گرفت. نتایج نشان داد که طول 13 توالی نوکلئوتیدی دهیدرین جو از 2117-720 نوکلئوتید متغییر بود. اکثر این ژن ها بر روی کروموزوم شماره 6 قرار داشتند. با توجه به مقدار آمینواسیدها، بیشترین فروانی اسید آمینه در تمامی این توالی ها مربوط به گلیسین با میانگین مقدار 44/24 درصد بود. بیشترین محل حضور ژن دهیدرین درون هسته، سیتوپلاسم و اندامک هایی مثل کلروپلاست و میتوکندری است. در تمامی این توالی ها سه موتیف اصلی k (لیزین)، s (سرین) و y (تیروزین) شناسایی شد. همچنین بررسی درخت فیلوژنتیکی نشان داد توالی xp-044954513.1 با فاصله بیشتر نسبت به دیگران و بدون زیر شاخه و به تنهایی در یک گروه قرارگرفته است. در این مطالعه پروتئین دهیدرین با شماره های دستیابی xp-044980250 با مقدار 89/6- پایدارترین و توالی پروتئین باشماره دستیابی xp-044952547 و مقدار 7/55 ناپایدارترین پروتئین بودند. بالا بودن ضریب خاموشی در تمام توالی ها نشاندهنده طول عمر بالا پروتئین هاست.