معرفی نسل جدید فناوری های توالی یابی و کاربردهای آن در مدیریت علف های هرز

تعیین توالی دی ان ای از مهمترین روش های موجود در زمینه زیست شناسی مولکولی بوده که به موجب آن می توان ترتیب قرار گرفتن نوکلئوتیدها را در رشته از دی ان ای مشخص نمود. تاکنون چندین نسل از فناوری های تعیین توالی معرفی شده اند که بر اساس ماهیت عملکرد و اطلاعات خروجی طبقه بندی می گردند. امروزه، با پیشرفت های قابل توجه ای که در ژنتیک مولکولی بدست آمده است، روش های سنتی توالی یابی به دلیل زمانبر بودن و هزینه بالا، پاسخگوی نیاز پژوهشگران نمی باشد. ظهور نسل جدید فناوری های توالی یابی علاوه بر فراهم آوردن میلیونها خوانش از محتوای ژنتیکی، نقش موثری نیز در کاهش هزینه های توالی یابی ایفا نموده است. فناوری نسل جدید توالی یابی قادر به توالی یابی سریع محتوای ژنتیکی در سطوح مختلف مانند ژنوم و ترنسکریپتوم می باشد. این فناوری ها، می توانند برای تعیین توالی ژن های موجود در دی ان ای هدف و تهیه خوانش های بلند به کار برده شوند. امروزه فناوری های نسل جدید توالی یابی، طیف وسیعی از کاربرد ها نظیر شناسایی تنوع های ژنتیکی، واکاوی داده های بیان ژن در سطح ترانسکریپتوم، شناسایی آر ان ای های غیر کد کننده، بررسی متیلاسیون و بررسی برهم کنش نوکلئیک اسید و پروتئین را شامل می شوند.

next generation sequencing and its applications in weed science

the dna sequencing is the most important technique in molecular biology by which the order ofthe nucleotides can be identified in a piece of dna. there are several generations of dna sequencingtechnologies that can be well characterized through their nature and the kind of output they provide.traditional sequencing methods are mainly based on the original sanger sequencing technique whichmakes them very expensive and low-throughput; thus, they do not meet the needs of researchers.consequently, with the considerable advances in molecular biology and the high demand for lowcostsequencing has encouraged the development of high-throughput sequencing (or next generationsequencing) technologies that parallelize the sequencing process, producing thousands or millions ofsequences concurrently. next-generation sequencing enables us to rapidly sequence a large piece ofdna which could span the whole genome with the latest instruments capable of producing gigabasesof data in one isolated sequencing run. next-generation sequencing platforms have a wide variety ofapplications, such as whole genome sequencing, de novo sequencing, rna sequencing (for applicationssuch as transcriptomic and small rna analysis), methylation analysis, and protein-nucleic acidinteraction analysis.