جداسازی ویروس‌های میکروبی از دریاچه ارومیه: حفظ ذخایر ژنتیکی

میکروارگانیسم های خاک برای چرخه مواد مغذی و حیات اکوسیستم ها ضروری هستند. بسیاری از مطالعات نشان می‌دهند که ویروس‌ها نقش مهمی در تکامل میزبان‌های باکتریایی خود دارند. دریاچه ارومیه سومین دریاچه بزرگ آب شور ایران است که در شمال غرب کشور قرار دارد. در سال های اخیر به دلیل خشکسالی و از بین رفتن بسیاری از گونه های زیستی در این دریاچه، شناسایی و حفظ ذخایر ژنتیکی دریاچه حیاتی شده است. در این تحقیق خاک و رسوب قسمت جنوبی دریاچه جمع آوری و به آزمایشگاه منتقل شد. با استفاده از روش‌های وابسته به کشت، آرکی‌ها، باکتری‌ها و فاژها جدا شدند. میزبان های باکتریایی و آرکی شناسایی شدند و ویروس های جدا شده از پلاک با میکروسکوپ الکترونی گزاره (tem) مشخص شدند. رقت های متوالی نمونه های خاک و رسوب بر روی محیط کشت swn یا mgm 23 درصد کشت داده شدند. کلنی های باکتری جدا و خالص شدند. شناسایی مولکولی میکروارگانیسم های باکتریایی با توالی یابی 16s rrna انجام شد. برای انجام سنجش پلاک، هاله ی لیز فیلتر شده به میزبان تلقیح شد. پس از جداسازی پلاک، ویروس‌ها با روش لکه گذاری خالص شدند و آنالیز مورفولوژیکی با رنگ‌آمیزی منفی و میکروسکوپ الکترونی گزاره انجام شد. تجزیه و تحلیل مورفولوژیکی پیشنهاد می‌کند که ویروس به شبیه myoviral و ویروس‌های پلئومورفیک است، در حالیکه دیگری مورفولوژی کروی با یک غشای داخلی احاطه شده توسط کپسید چند وجهی نشان داد.

isolation of microbial viruses from urmia lake: preserving genetic resources

soil microorganisms are essential for the nutrient cycle and the life of ecosystems. many studies show viruses play an important role in the evolution of their bacterial hosts. urmia lake is the third largest saline lake in iran, located in the north-western part of the country. in recent years, due to drought and the loss of many biological species in this lake, the identification and conservation of the lake’s genetic resources have become critical. in this study, soil and sediment from the southern part of the lake were collected and transferred to the laboratory. using culture-dependent approaches, archaea, bacteria, and phages were isolated. bacterial and archaeal hosts were identified, and plaque-isolated viruses were characterized by transmission electron microscopy. serial dilutions of soil and sediment samples were cultured on swn or mgm 23% media. bacterial colonies were isolated and purified. molecular identification of bacterial microorganisms was performed by 16s rrna sequencing. to perform a plaque assay, the filtered lysate was inoculated onto hosts. after plaque isolation, viruses were purified with a spot assay, and morphological analysis was performed by negative staining and transmission electron microscopy. the morphological analysis proposes that the virus is related to myoviral like form and pleomorphic viruses while another showed spherical morphology with an inner membrane surrounded by an icosahedral capsid.