نقش pbs در متابولیسم mrna چیست؟

بخش‌های بدون غشاء مانند بدنه‌های پی (pbs) و گرانول‌های استرسی (sgs) نقش مهمی در تنظیم بیان ژن در پاسخ به استرس‌های محیطی ایفا می‌کنند. این‌ها مجموعه‌هایی از پروتئین و rna هستند که تحت شرایطی که ترجمه مهار می‌شود، به صورت تراکم‌هایی شکل می‌گیرند. در مطالعات قبلی، ما به طور سیستماتیک و کمی، ترکیب پروتئین و mrna در pbs و sgs تشکیل شده پس از استرس تغذیه‌ای را تعیین کرده‌ایم. ما اجزای پروتئینی و rna مشترک بسیاری را در pbs و sgs کشف کردیم که از پروفایل تعاملی پیچیده‌ای در طی بلوغ این تراکم‌های زیستی حمایت می‌کنند. ما این مطالعات را گسترش داده‌ایم تا نیازهای عملکردی pbs را در شرایط استرس تغذیه‌ای بررسی کنیم. ابتدا فرض شده بود که pbs محل‌هایی برای تجزیه mrna سلولی هستند. اما اخیراً pbs به عنوان مکان‌های ذخیره‌سازی برای mrnaهای تحت ترجمه مهار شده پیشنهاد شده‌اند که می‌توانند از pbs خارج شده و ترجمه را مجدداً آغاز کنند. این دو عملکرد متناقض نیستند و ما در حال آزمایش این فرضیه هستیم که pbs به طور هدفمند برای حذف mrnaهای خاص یا به منظور نگهداری آن‌ها برای ذخیره‌سازی عمل می‌کنند. نتایج این مطالعه داده‌های جدید ما را که به بررسی سرنوشت mrna و تشکیل pb در جهش‌یافته‌هایی که فاقد پروتئین‌های pb شناسایی شده در تحلیل پروتئومیکس ما هستند، ارائه خواهد کرد. آزمایش‌های ما اجزای کلیدی pb را که برای عملکرد pb ضروری هستند، برجسته کرده است و ما در حال حاضر نقش آن‌ها در متابولیسم mrna در شرایط استرس تغذیه‌ای را بررسی می‌کنیم. این مطالعات اهمیت زیادی دارند زیرا مونتاژ یا جداسازی نادرست این گرانول‌ها می‌تواند پیامدهای پاتولوژیکی در عفونت‌های ویروسی، درمان سرطان و تخریب  عصبی داشته باشد.

what is the role of pbs in mrna metabolism?

non-membrane-bound compartments such as p-bodies (pbs) and stress granules (sgs) play important roles in the regulation of gene expression following environmental stresses. they are protein and rna assemblies that form condensates under conditions where translation is repressed. in previous studies we have systematically and quantitatively determined the protein and mrna composition of pbs and sgs formed after nutrient stress. we uncovered numerous common protein and rna components across pbs and sgs that support a complex interaction profile during the maturation of these biological condensates. we have extended these studies to examine the functional requirements for pbs during nutrient stress. pbs were originally hypothesised to be sites of cellular mrna decay. however, pbs have more recently been proposed to act as storage sites for translationally repressed mrnas that can exit pbs and re-initiate translation. these two functions are not mutually exclusive, and we are testing the hypothesis that pbs functionin a targeted manner either to remove specific mrnas, or to sequester them for storage. the outcomes of the study will present our recent data examining mrna fate and pb formation in mutants lacking individual pb proteins identified in our proteomics analysis.our experiments have highlighted key pb components that are required for pb function, and we are currently examining their roles in mrna metabolism during nutrient stress. these studies are important since the aberrant assembly or disassembly of these granules has pathological implications in cancer, viral infection and neurodegeneration.