بررسی حضور باکتری فوزوباکتریوم نوکلئاتوم در بیوپسی نمونه های بالینی بافت سرطان کولورکتال و بافت سالم مجاور

بیماری سرطان کولورکتال یک بدخیمی رایج در سطح جهان و مانعی مهم در افزایش امید به زندگی می باشد. در روند شکل گیری و پیشروی این عارضه علاوه بر جهش های سوماتیک خاص در ژن های مختلف، عوامل مهم دیگری اعم از تغییرات میکروبیوم دستگاه گوارش نیز می توانند اثرگذار باشد که در این میان می توان به اهمیت باکتری فوزوباکتریوم نوکلئاتوم اشاره کرد. در این مطالعه ابتدا تعدادی نمونه بافت مبتلا به سرطان کولورکتال به همراه بافت سالم مجاور آنها تهیه گردید و محتوای dna آنها استخراج گردید. به منظور شناسایی مولکولی باکتری فوزوباکتریوم نوکلئاتوم در نمونه ها، یک جفت پرایمر الیگونوکلئوتیدی پرکاربرد بر اساس سایر مطالعات سنتز گردید. پس از بررسی و بهینه سازی شرایط اتصال پرایمرها به ناحیه هدف، با استفاده از روش pcr، چرخه های دمایی اعمال و محصول تکثیر ژن بر روی ژل آگارز رویت گردید. در دو نوع نمونه بررسی شده تفاوت آشکاری از نظر وجود قطعه تکثیر شده هدف با طول 112 جفت باز مشاهده نشد. در نتیجه، هم در بافت سرطانی و هم در بافت سالم مجاور حضور باکتری و باند امپلیکون تایید شد و قطعات تکثیر شده الگوی نسبتا مشابهی در هر دو نوع نمونه داشتند. این موضوع می تواند بیانگر آن باشد که تفاوتی در حضور این باکتری در بافت سرطانی و بافت سالم مجاور آن وجود ندارد و پیشنهاد می شود تا بررسی مشابهی با روش های کمی و شامل جامعه افراد سالم و تعداد نمونه بیشتر انجام شده تا از تفاوت حضور این باکتری اطمینان حاصل گردد.

investigating the presence of fusobacterium nucleatum in the biopsy of clinical samples of colorectal cancer tissue and adjacent healthy tissue

colorectal cancer is a common malignancy worldwide and an important obstacle in increasing life expectancy. during the formation and progression of this complication, in addition to specific somatic mutations in various genes, other important factors such as changes in the microbiome of the gastrointestinal tract play a role, among which the importance of fusobacterium nucleatum can be mentioned. in this study, first, a number of colorectal cancer tissue with their adjacent healthy tissue samples were collected and their dna content was extracted. to molecularly detect fusobacterium nucleatum in the samples, a pair of widely used oligonucleotide primers based on other studies were synthesized. after examining and optimizing primer binding conditions to the target area, temperature cycles were applied using the pcr method, and the gene amplification product was observed on the agarose gel. between the two types of studied samples, no obvious difference was observed regarding the target amplified fragment with a length of 112 bp. therefore, the presence of the bacterium and the amplicon band was confirmed both in the cancerous and the adjacent healthy tissue, and the amplified fragments had a relatively similar pattern in both types of samples. this can indicate that there is no difference in the presence of this bacterium in the cancerous and the healthy tissue adjacent to it, and it is suggested that a similar study with quantitative methods including the population of healthy people and a larger number of samples is done to determine the difference in the presence of this bacteria.