ارزیابی فواصل ژنتیکی باکتری‌های اسید لاکتیک (labs) موجود در شیر مادر با استفاده از نشانگرهای مولکولی مبتنی بر pcr

شیر مادر به واسطه دارا بودن طیف وسیعی از باکتری‌های پروبیوتیک‌، از ارزش زیستی بسیار بالائی برای کودک برخوردار است. با توجه به اهمیت بالای باکتری‌های اسید لاکتیک (labs) و خواص پروبیوتیکی آنها، مطالعه حاضر به منظور جداسازی، شناسایی و بررسی تنوع ژنتیکی این گروه از باکتری‌ها در شیر مادر با استفاده از نشانگر‌های مولکولی rep و box اجرا شد. نمونه‌های شیر مادر از نواحی جغرافیایی مختلف استان لرستان جمع‌آوری و پس از کشت باکتری‌های موجود در نمونه‌های مورد مطالعه، از روش‌های مورفولوژیک، آزمون‌های گرم، کاتالاز و آنتی‌بیوگرام جهت تایید اولیه استفاده شد. فواصل ژنتیکی بین 20 نمونه انتخاب شده با استفاده از نشانگرهای rep-pcrو box-pcr برآورد شد. براساس نتایج اولیه، 3 ایزوله از گروه‌های هتروژن انتخاب و جهت تعیین نوع باکتری از تکثیر ژن 16srrna و توالی‌یابی و همردیفی آن استفاده شد. نتایج نشان داد که باکتری‌های مورد مطالعه کوکوباسیل شکل، گرم مثبت و کاتالاز منفی بودند. گروه‌بندی و رسم دندروگرام نشان داد که باکتری‌های مورد مطالعه با حداقل 23 و حداکثر 86 درصد چندشکلی در 5 گروه مختلف قرار گرفته و گروه‌های تشکیل شده با فواصل جغرافیایی مطابقت نسبی داشتند. نتایج توالی‌یابی ژن 16srrna نیز بیانگر شناسایی 3 گونه باکتری لاکتوباسیلوس فرمنتوم، لاکتوباسیلوس کونکئی و لاکتوباسیلوس آپودمی در نمونه‌های شیر مادر بود. با توجه به نتایج به دست آمده می‌توان بیان کرد که شیر مادر حاوی طیف گسترده‌ای از باکتری‌های اسید لاکتیک بوده و نشانگرهای مولکولی مبتنی بر dna می‌توانند ابزار موثری در گروه‌بندی و شناسایی آنها باشند.

evaluation of genetic distances of lactic acid bacteria (labs) in breast milk using pcr-based molecular markers.

breast milk has a very high biological value for the child due to having a wide range of probiotic bacteria. considering the high importance of lactic acid bacteria (labs) and their probiotic properties, the present study was conducted to isolate and investigate the genetic diversity of this group of bacteria in breast milk using rep and box molecular markers. breast milk samples were collected from different geographical areas of lorestan province and after culturing the bacteria in the studied samples, morphological methods, gram tests, catalase and antibiogram were used for initial confirmation. genetic distances between 20 selected samples were estimated using rep-pcr and box-pcr markers. based on the initial results, 3 isolates were selected from heterogeneous groups and 16srrna gene amplification and sequencing and alignment were used to determine the type of bacteria. the results showed that the studied bacteria were coccobacilli, gram positive and catalase negative. the grouping and drawing of the dendrogram showed that the studied bacteria with a minimum of 23% and a maximum of 86% polymorphism were placed in 5 different groups and the groups formed were in relative agreement with the geographical distances. the results of 16srrna gene sequencing indicated the identification of 3 species of lactobacillus fermentum, l. konkei and l. apodemy in breast milk samples. according to the obtained results, it can be stated that breast milk contains a wide range of lactic acid bacteria and dna-based molecular markers can be an effective tool in their grouping and identification.