جداسازی و شناسایی سویه بومی fusarium sp. از دریای خزر: مطالعه موردی

فوزاریوم گروه بزرگی از قارچ‌های رشته‌ای، معروف به هیفومیست‌ها است که معمولاً در خاک و همراه با گیاهان یافت می‌شوند. برخی از این قارچ ها پاتوژن‌های مهم گیاهی هستند. نمونه‌های رسوبی از عمق 3 متری در سواحل جنوبی دریای خزر جمع آوری شدند. سوسپانسیون همه‌ی نمونه‌ها در سرم فیزیولوژی تهیه شد. برای جداسازی میکروارگانیسم‌ها از روش کشت سطحی بر روی پلیت‌های حاوی سیب‌زمینی دکستروز آگار (pda) استفاده شد. به منظور خالص‌سازی جدایه قارچی از روش تک اسپور بر روی محیط واتر آگار (wa) استفاده شد. بررسی خصوصیات مورفولوژیکی جدایه قارچی با استفاده از روش میکروکشت و گرماگذاری در دمای 30 درجه سانتی‌گراد به مدت 5 تا 7 روز انجام شد. شناسایی مولکولی جدایه قارچی با تعیین توالی dna به روش pcr با استفاده از پرایمرهای its1 و its4 انجام شد. تراز توالی مناطق مختلف its جدایه قارچی با استفاده از الگوریتم blast در پایگاه داده‌ی مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (ncbi) تعیین شد. تجزیه و تحلیل توالی ناحیه its ریبوزومی تکثیر شده جدایه قارچی در پایگاه اطلاعاتی ncbi و مقایسه آن با توالی‌های مشابه از طریق نرم‌افزار blast نشان داد که این جدایه بیشتر از 99 درصد با خانواده‌ی نکتریاسه و جنس فوزاریوم شباهت دارد.

isolation and identification of a native strain of fusarium sp. from the caspian sea: a case study

fusarium is a large group of filamentous fungi, known as hyphomycetes, that are commonly found in soil and are associated with plants. some of these fungi are important plant pathogens.caspian sea sediments were collected from 3 meters deep. samples were suspended using physiological saline, and suspensions of all soil samples were prepared. the spread plate technique on potato dextrose agar (pda) plates was employed to isolate microorganisms. in order to purify the fungal isolate, single-spore method was used on water-agar (wa) medium.the investigation of the morphological characteristics of the fungal isolate was carried out using  slide culture method and incubation at 30 ºc for 5 to 7 days. molecular identification of fungal isolate was conducted by dna sequencing by pcr assay using its1 and its4 primers. a sequence alignment of various fungal its regions was constructed using the basic local alignment search tool (blast) algorithm in the national center for biotechnology information (ncbi) database. analysis of the amplified ribosomal its region sequence of the fungal isolate in the ncbi database and comparison with similar sequences via blast software showed that this isolate was more than 99% identical to the family nectariaceae and genus fusarium.