بررسی داکینگ مولکولی ترکیبات گیاه مرزنجوش با پروتئین متصل شونده به پنی سیلین شماره2a باکتری استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متیسیلین

عفونت های باکتری استافیلوکوکوس اورئوس یک نگرانی عمده برای سیستم سلامت می باشد چرا که این باکتری نسبت به آنتی بیوتیک های رایج مقاومت پیدا کرده است. یکی از عوامل اصلی مقاومت پروتئینی به نام پروتئین متصل شونده به پنی سیلین2a است. مطالعات پیشین نشان داده اند که عصاره گیاه مرزنجوش قادر به از بین بردن سویه های مقاوم این باکتری است. بنابر این، هدف از مطالعه حاضر داکینگ مولکولی ترکیبات گیاه مرزنجوش با پروتئین متصل شونده به پنی سیلین2a بود تا ترکیبات مهاری احتمالی این پروتئین مشخص شوند. با استفاده از پایگاه های داده lotus و npass ترکیبات گیاه مرزنجوش استخراج شد و با استفاده از پایگاه داده pubchem با فرمت sdf ذخیره سازی شد. ساختار پروتئین متصل شونده به پنی سیلین2a از بانک اطلاعاتی pdb استخراج و با فرمت pdb ذخیره شد. سپس، با استفاده از نرم افزار pyrx داکینگ مولکولی بین ترکیبات گیاه و جایگاه فعال آنزیم انجام شد. درنهایت، مطالعه فارماکوکینتیک و سمیت ترکیبات منتخب با استفاده از پایگاههای داده آنلاین انجام شد. نتایج نشان داد که دو ترکیب ursolic acid و sonchuside h داری بیشترین نیروی اتصال (8/8 کیلوکالری بر مول) با جایگاه اتصال آنزیم هدف بودند. علی رغم اینکه هر دو ترکیب در مطالعات فارماکوکینتیک خواص مناسبی داشتند در مطالعات بعدی سمیت نسبی از خود نشان دادند. در نتیجه، علی رغم اینکه این ترکیبات گیاه مرزنجوش احتمالا خواص دارویی بر علیه پروتئین متصل شونده به پنی سیلین2a داشتند ولی به دلیل سمیت نسبی نمی توان آنها را به عنوان کاندیدای دارویی معرفی کرد.