مقایسه توالی ژن hspa6 در گونه‌های مختلف

پروتئین‌های شوک حرارتی (hspها) نقش کلیدی را در مقاومت در برابر استرس و هموستازی پروتئین بازی‌ می‌کنند. بنابراین، یکی از پاسخ‌های معمول فیزیولوژیکی بدن در شرایط استرس گرمایی و سایر استرس‌ها، افزایش بیان پروتئین‌های شوک گرمایی (hsp) می‌باشد. هدف از این مطالعه بررسی پروتئین hspa6 در گونه‌های شتر و انسان به عنوان گونه‌های بسیار مقاوم و دارای مقاومت متوسط در برابر استرس و سایر گونه‌ها در کنار آنهاست. در این مطالعه ژن hspa6 انسان، شترهای تک‌کوهانه عربی و ترکمن، شترهای دوکوهانة اهلی و وحشی، گاوهای تائوروس، ایندیکوس و آمیخته‌های آنها و همچنین یاک وحشی، گوسفند، بز، گورخر، اسب و اسب پرزوالسکی مورد مقایسه قرار گرفتند. برای درک بیشتر فاصله ژنتیکی و تکاملی هر یک از گونه‌ها نسبت به یکدیگر، تنوع ژنتیکی موجود در توالی dna، اگزون‌ها و پروتئین مورد بررسی قرار گرفت. در این مطالعه گونة انسان علیرغم فاصله از لحاظ توالی ژن و اگزون، از لحاظ توالی پروتئین بین شترهای کوهان‌دار و اسب‌سانان قرار گرفت. همچنین ساختار سوم این پروتئین با استفاده از نرم افزار انلاین swissmolel تعیین گردید و نشان داده شد که تفاوت ساختاری این پروتئین در بین گونه های مختلف وجود ندارد. با توجه به نتایج بدست آمده از لحاظ توالی پروتئین وساختار، امکان وجود عامل دیگر فیزیولوژیکی مکمل علاوه بر توالی پروتئین را تقویت می‌نماید.

Comparison of HSPA6 gene sequence in different species

Heat shock proteins (HSPs) play a key role in stress resistance and protein homeostasis. Therefore, one of the usual physiological responses of the body in the conditions of heat stress and other stresses is the increase in the expression of heat shock proteins (HSP’s). The purpose of this study is to investigate the HSPA6 protein in camel and human species as very resistant species and moderate resistant specie and other species. In this study, The HSPA6 gene of humanHSPA6, Arabian and Turkmen camels, domestic and wild two-humped camels, Taurus, Indicus and their hybrids, as well as wild yak, sheep, goat, zebra, horse and Przewalski horse were compared. To better understand the genetic and evolutionary distance of each of the species to each other, the genetic diversity in DNA sequence, exons and protein was studied. In this study, despite the distance in terms of gene and exon sequence, the human species was placed between humpback camels and equines in terms of protein sequence. Also, the three-D structure of this protein was determined using Swissmolel online software and it was shown that there is no structural difference of this protein among different species. According to the results obtained in terms of protein sequence and structure, it strengthens the possibility of the presence of another complementary physiological factor in addition to protein sequence.