رویکردی جدید برای مطالعه پویش ژنومی با استفاده از میانگین عملکرد هر نژاد

مطالعات گسترده ژنتیکی همراه با پیشرفت فناوری توالی یابی منجر به تولید حجم بسیار بالایی از داده های ژنومی و فنوتیپی شده است که در پایگاه داده ها در دسترس می باشد. روش های جدیدی که بتواند از این حجم داده های مذکور جهت مطالعات تکمیلی در راستای مطالعه پویش کل ژنوم (gwas) استفاده کند بسیار ارزشمند خواهد بود و می تواند در شناسایی ژن های موثر سودمند باشد. لذا هدف مطالعه حاضر تشریح مطالعات و مدل های آماری است که بتوان با ایجاد ارتباط بین داده های ژنومی موجود در پایگاه داده ها و 'میانگین عملکردی نژاد ها' بعنوان یک فنوتیپ جایگزین شده با اطلاعات فنوتیپ فردی یک جمعیت برای مطالعه پویش کل ژنوم استفاده کرد. این نوع مطالعات در جمعیتی از نژادهای مختلف یک گونه با هدف شناسایی عومل موثر در بروز تفاوت صفات فنوتیپی در بین نژادها (کلاس ها) قابل اجرا می باشد. نتایج این مطالعه نشان می دهد که روش مذکور یک رویکردی مفید برای استفاده از 'میانگین عملکردی نژاد' بعنوان یک نماینده مناسب برای مقادیر فنوتیپ فردی در راستای استفاده از حجم بالای داده های ژنومی در دسترس برای مطالعات پویش ژنومی می باشد

A new approach for GWAS using the breed average performance

Extensive genetic research along with the advancement of sequencing technology has led to the production of a very high volume of genomic and phenotypic data that is available in databases. New methods that can use this volume of data for further studies, including genome-wide association studies (GWAS), will be very beneficial and can be used to identify effective genes. Therefore, the aim of the present study is to describe the studies and statistical models that can be used to perform genome-wide association studies by establishing a relationship between the available genomic data and 'breed average' as replaced by the data collected on the individuals in a population. This type of method can be used on the population of various breeds of the same species with the aim of identifying the effective factor in the occurrence of phenotypic trait differences among breeds (classes). The results of this study show that the 'breed average' approach is a useful proxy for phenotype individual value in order to use deposited genomic data in dataset for genome-wide association studies.