بررسی برخی عوامل موثر بر متوسط رابطه خویشاوندی در گاوهای بومی

تنوع ژنتیکی، گام اول برای ایجاد یک برنامه اصلاح‌نژادی، یا انجام اقدامات حفاظتی است. تنوع ژنتیکی، به عنوان معیار تفاوت‌های ژنتیکی بین و درون گروه‌های حیوانات تعریف می‌شود و به شدت با انتخاب و سازگاری یک نژاد با محیط محلی خود مرتبط است. حفظ تنوع ژنتیکی، به عنوان بیمه‌ای است که ما را در برابر شرایط نامطلوب آینده حفظ می‌کند. تنوع ژنتیکی، این امکان را به جمعیت دامی می‌دهد، که از نظر ژنتیکی با یک محیط در حال تغییر سازگار شوند یا آن را در برابر رویدادهای تصادفی، مانند آب و هوای سخت یا شیوع بیماری محافظت کنند. بنابراین تنوع ژنتیکی، یک موضوع بسیار مهم در توسعه استراتژی‌های مدیریتی برای جمعیت‌های در معرض خطر در سراسر جهان است. هدف از پژوهش حاضر، بررسی برخی عوامل موثر بر متوسط میزان رابطه خویشاوندی، شامل روش انتخاب، سامانه‌ی آمیزشی، نسبت نر به ماده و اندازه‌ی جمعیت در گاوهای بومی بود. برای این کار از داده‌های شبیه‌سازی استفاده شد. برای شبیه‌سازی جمعیت، از نرم‌افزار qmsim و برای تجزیه و تحلیل شجره، از نرم‌افزار‌pedig استفاده شد. نتایج نشان داد، برای کاهش متوسط میزان رابطه خویشاوندی و حفظ تنوع ژنتیکی جمعیت گاو بومی، بهترین استراتژی، استفاده از روش انتخاب به کمک نشانگرهای مولکولی، سامانه‌ی آمیزشی بر اساس کمترین میزان هم خونی، نسبت نر به ماده بزرگ‌تر و استفاده از جمعیت بزرگ می‌باشد. همچنین استفاده از نشانگرهای مولکولی در جمعیت‌های بومی کشور، کمک بزرگی به حفظ تنوع ژنتیکی خواهد کرد.

Investigating some influencing factors on the total average relatedness in native cattle

Genetic diversity is the first step in creating a breeding program or implementing conservation measures. Genetic diversity is defined as a measure of genetic differences between and within groups of animals and is strongly related to the selection and adaptation of a breed to the local environment. Maintaining genetic diversity is an insurance that protects us against future adverse conditions. Genetic variation allows an animal population to genetically adapt to a changing environment or protect it against random events such as harsh weather or disease outbreaks. Genetic diversity is therefore a very important issue in the development of management strategies for endangered populations worldwide. The purpose of this study was to investigate some factors affecting the total average relatedness, including selection method, mating system, male to female ratio and population size in native cattle. For this purpose, simulation data was used. Population simulation was done using QMSim software and Pedig software was used for pedigree analysis. The results showed that in order to reduce the average relatedness and maintain the genetic diversity of the native cattle population, the best strategy is to use the selection with the assistance of molecular markers, mating system based on the lowest rate of inbreeding, larger male to female ratio and using a large population. Also, the use of molecular markers in the native populations of the country will greatly help to maintain genetic diversity