شناسایی ژن‌های کاندید مرتبط با صفات تولیدمثلی با تراشه‌ اسنیپ در سه نژاد گوسفند بومی ایران

تولیدمثل، یکی از عوامل اصلی تاثیرگذار بر صنعت دامپروری و یک فرآیند فیزیولوژیکی پیچیده، اما مهم است. اساس تولید گوسفند، که بخش مهمی از صنعت دامپروری جهان می‌باشد به موفقیت در تولید مثل بستگی دارد. توسعه نشانگرهای مولکولی با فراهم کردن ابزارهایی برای کشف ژن‌های موثر برصفات مختلف، فرصتی جدید برای بهبود و پیشرفت ژنتیکی در اصلاح نژاد دام ایجاد کرده‌اند. ایران یکی از مناطق مهم ذخایر ژنتیکی گوسفند در جهان است. در این تحقیق ژن‌های کاندید مرتبط با ثولیدمثل تحت انتخاب مثبت در نژادهای ایرانی مشخص گردید. بدین منظور از آماره‌های شاخص تثبیت (fst) و تنوع نوکلئوتیدی (pi) ، برای مقایسه داده‌های حاصل از آرایه illumina ovine snp50 beadchip سه نژاد گوسفند بومی ایران (مغانی، افشاری و قزل) با نژادهای غیربومی تجاری (ایست فریزین سفید، ایست فریزین قهوه ای ، لاکن، دورست هورن و تکسل)، برای کشف ژنهای کاندید استفاده شد. تجزیه و تحلیل‌ یافته‌ها در این مطالعه منجر به شناسایی ژن‌های کاندید درگیر در صفات اندازه بستر (spats2l, ntrk2, rora)، عملکرد تخمدان (hsd17b12)، تشکیل استرومای تخمدان fbn3))، تعداد جنین(dennd1a)، مورفولوژی‌اسپرم(dscaml1)،عملکردفولیکول (hspg2)، گامتوژنژ(ube4a) وآبستنی(ranbp17) در گوسفند گردید که می‌توانند در برنامه های اصلاح نژادی قابل استفاده باشند.

Identification of candidate genes related to reproductive traits with the SNP chip in three native sheep breeds of Iran

Reproduction is one of the main factors influencing the animal husbandry industry and is a complex but essential physiological process. The basis of sheep production, an important part of the world's livestock industry, depends on reproductive success. The development of molecular markers has created a new opportunity for improvement and genetic progress in animal breeding by providing tools to discover genes effective in different traits. Iran is one of the important areas of sheep genetic reserves in the world. In this research, candidate genes related to reproduction under positive selection in Iranian breeds were determined. For this purpose, from the stability index (FST) and nucleotide diversity (Pi) statistics, to compare the data obtained from the Illumina Ovine SNP50 BeadChip array of three native Iranian sheep breeds (Moghani, Afshari, and Qezel) with non-native commercial breeds (White East Friesian, Brown East Friesian, Milk Lacaune, Dorset Horn and Texel), was used to discover candidate genes. The analysis of the findings in this study led to the identification of candidate genes involved in litter size traits (SPATS2L, NTRK2, RORA), ovarian function (HSD17B12), ovarian stroma formation (FBN3)), the number of embryos (DENND1A), sperm morphology (DSCAML1), The functions of a follicle (HSPG2), gametogenesis (UBE4A) and pregnancy (RANBP17) in sheep were determined which can be used in breeding programs.