تعیین هویت مولکولی ماکرورابدوس اورنیتوگاستر(macrorhabdus ornithogaster) در پرندگان زینتی

ماکرورابدوزیس یا مگاباکتریوزیس، سندرم تحلیل برندۀ پرندگان است که قارچ ornithogaster macrorhabdus  آن را ایجاد می‌کند. هدف از این پژوهش، تشخیص مولکولی قارچ ماکرورابدوس اورنیتوگاستر با روش pcr، از مدفوع پرندگان با علائم بالینی و آنالیز فیلوژنی بین جدایه‌های جمع‌آوری شده بود. در این پژوهش 54 نمونه مثبت از بین300 پرندۀ مشکوک مراجعه‌کننده به‌روش اسمیر مرطوب شناسایی شد. سپس از روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (pcr) برای تشخیص نهایی استفاده شد. نمونه‌های مثبت با استفاده از آغازگرهای عمومی (panfungal) با روش pcr بررسی شدند. برای آنالیز فیلوژنی 15 نمونه تعیین توالی شدند، توالی‌های به‌دست‌آمده با توالی‌های ثبت‌شده در بانک جهانی ژن مقایسه و درصد شباهت و هم‌پوشانی بین توالی‌ها بررسی شد. از تعداد 300 نمونه مدفوع با تکنیک اسمیر مرطوب بررسی ‌شده 54 نمونه مثبت بودند. از این تعداد 33 نمونه با روش pcr مثبت شدند. بر اساس توالی‌یابی، ماکرورابدوس اورنیتوگاستر تنها در دو نمونۀ کوتوله برزیلی (lovebird) تشخیص داده شد. آنالیز فیلوژنی نمونه‌های مثبت در این مطالعه نشان داد که موارد مثبت جداشده از باجی‌ها و فنچ‌ها، دارای تشابه (86.76 -100 درصد) با توالی‌های ثبت‌ شده در (ncbi) بودند. همچنین، نتایج نشان داد که تکنیک pcr به‌علت دقت، حساسیت و سرعت در روند تشخیص می‌تواند موثر باشد.

molecular identification of macrorhabdus ornithogaster in companion bird

macrorhabdosis, also known as megabacteriosis, is a wasting disease in birds caused by the fungus macrorhabdus ornithogaster. this study aimed to detect the fungus using pcr from the feces of birds showing clinical signs of infection, and to perform a phylogenetic analysis of the collected isolates. in this study, 54 positive samples were detected among the 300 suspicious birds referred to the wet smear method. subsequently, the polymerase chain reaction (pcr) technique was employed for the final diagnosis. positive samples were then subjected to pcr analysis using panfungal primers. for phylogenetic evaluation, 15 samples were sequenced, and the resulting sequences were compared with entries in the world genebank to assess their similarity and overlap. a total of 300 stool samples were subjected to analysis using the wet smear technique, of which 54 were found to be positive. furthermore, 33 samples were identified as positive using the pcr method. sequencing revealed the presence of m. ornithogaster in only two samples from lovebirds. phylogenetic analysis showed an 86.76%-100% similarity between the isolates from budgerigars and finches and sequences recorded in the ncbi database. these findings highlight that pcr is an effective diagnostic tool for m. ornithogaster due to its speed, accuracy, and sensitivity.