دسته بندی فیلوژنتیکی جدایه‌های اشریشیاکلی به‌دست آمده از موارد عفونت ادراری شهرستان بجنورد به روش جدید گروه‌بندی کلرمونت

عفونت‌های ادراری uti یکی بارزترین عفونت‌ها در بیماران مراجعه کننده به بیمارستان و همچنین اشریشیاکلی شایع‌ترین پاتوژن و همچنین مسئول 85-50 درصد عفونت‌های ادراری در جوامع و بیمارستان‌ها است. نوترکیبی‌ها، در جمعیت باکتری اشریشیاکلی منجر به تنوع در میان آنها و شکل‌گیری گروه‌های فیلوژنتیک می‌گردد. با تعیین هویت اجدادی سویه‌ها و گروهی که باکتری به آن تعلق دارد، می‌توان به ماهیت بیماری‌زا یا فلور طبیعی یا پاتوژن بودن باکتری پی برد. در این مطالعه در بازه‌ی زمانی 4 ماهه تعداد 50 نمونه از کشت‌های مثبت دارای عفونت ادراری ارجاع شده به آزمایشگاه مستقر در بیمارستان ثامن‌الائمه شهرستان بجنورد مورد بررسی قرار گرفت. پلیت‌های دارای باکتری که در محیط کشت مک‌کانکی آگار دارای کلنی‌های صورتی رنگ بودند به‌عنوان جدایه‌های مشکوک به اشریشیاکلی انتخاب شدند و به‌وسیله‌ آزمایش‌های بیوشیمیایی imvic تایید جدایه‌ها صورت پذیرفت. در این مطالعه از روش pcr و پرایمرهای طراحی شده از چهار ژن yjaa،chua ،arpa  و tspe4.c2 جهت تعیین گروه‌های فیلوژنتیکیc ،f ،e ،b2 ،b1 ،a  و  d استفاده گردید. در این مطالعه میزان فراوانی گروه‌های فیلوژنتیکی به ترتیب b2 %24 ، f %22 ، b1 %18 ،d   %16 ،a   %8 ، c %6 و e %6 مشاهده گردید. تمامی جدایه‌های مورد مطالعه با کمک روش جدید دسته‌بندی فیلوژنتیکی کلرمونت قابل دسته‌بندی بودند. در میان جدایه‌های مورد مطالعه طیف گوناگونی از گروه‌های فیلوژنتیکی مشاهده گردید.

phylogenetic classification of escherichia coli isolates obtained from uri-nary tract infections in bojnourd city by the new clermont grouping method

urinary tract infections utis are one of the most common infections in hospitalized patients and escherichia coli is the most common pathogen and is also responsible for 50-85% of urinary tract infections in communities and hospitals. recombinations in escherichia coli bacterial populations lead to diversity among them and the formation of phylogenetic groups. by determining the ancestral identity of the strains and the group to which the bacterium belongs, the pathogenic nature or natural flora of the bacterium can be understood. in this study, in a period of 4 months, 50 samples of positive cultures with urinary tract infections were referred to the laboratory located in samen al-a’meh hospital in bojnourd. . bacterial plates containing pink colonies in mcconkey agar medium were selected as suspected escherichia coli isolates and, after confirmation by biochemical tests imvic was performed to confirm the isolates. in this study, four genes yjaa, chua, arpa and tspe4.c2 were used to determine phylogenetic groups c, f, e, b2, b1, a and d. in this study, the frequency of phylogenetic groups were b2 24% , f 22% , b1 18% , d 16% , a 8% , c 6% and e 6% , respectively seen. all studied isolates could be classified using the new clermont phylogenetic classification method. a variety of phylogenetic groups were observed among the studied isolate.