شناسایی کمپلکس های پروتئینی با استفاده از داده های زیستی و خوشه بندی فازی
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
مولی وردیخانی مریم ,جلیلی سعید
|
|
منبع
|
كنفراس فناوري اطلاعات و دانش (ikt2021) - 1400 - دوره : 12 - کنفراس فناوری اطلاعات و دانش (IKT2021) - کد همایش: 00210-94457 - صفحه:0 -0
|
|
چکیده
|
شناسایی کمپلکس های پروتئینی از روی شبکه های برهمکنش پروتئینی یکی از وظایف بنیادی در بیوانفورماتیک است. روش های آزمایشگاهی داده های با ارزشی برای استنتاج کمپلکس های پروتئینی فراهم کرده اند. با این وجود، این روش ها محدویت های ذاتی دارند. با توجه به این محدودیت ها، در دهه گذشته روش های محاسباتی بسیاری برای شناسایی کمپلکس های پروتئینی، ارائه شده اند. در بسیاری از روش های ارائه شده ماهیت پویا و همپوشانی کمپلکس های پروتئینی نادیده گرفته می شود. در این طرح، روشی با استفاده از شبکه برهمکنش پروتئین، داده های بیان ژن، گراف هستان شناسی ژن، داده tap و الگوریتم خوشه بندی فازی c-means برای شناسایی کمپلکس های پروتئینی ارائه شده است. نتایج آزمایش ها نشان می دهد این روش نسبت به سایر روش های به روز شناسایی کمپلکس های پروتئینی عملکرد بهتری دارد.
|
|
کلیدواژه
|
داده بیان ژن، داده tap، شبکه برهمکنش پروتئین، کمپلکس پروتئینی، گراف هستان شناسی ژن
|
|
آدرس
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|