بررسی بیوانفوماتیکی خصوصیات پروتئین ema2 به منظور استفاده در روش های تشخیص سرولوژیکی تیلریا اکوئی در اسب

تیلریا اکوئی عامل بیماری پیروپلاسموز در اسب می باشد. این بیماری در اکثر نقاط دنیا گزارش شده است. می توان با استفاده از روش های سرولوژیکی این بیماری را در اسب ها تشخیص داد. بدین منظور باید جهت بالا بردن حساسیت و وییگی این روش ها از آنتی زن های اختصاصی این انگل استفاده کرد. یکی از آنتی ژن های مهم که بدین منظور استفاده می شود پروتئین سطحی مروزئیت تیلریا اکوئی (ema-2) می باشد. در این مطالعه خصوصیات مختلف این پروتئین اعم از خصوصیات مرفولوژیکی و بیوشیمیایی و ایمنولوژیک با استفاده از سرورهای مختلف بررسی شده است.پروتئین ema-2 دارای 274 اسید آمینه است با وزن ملکولی 29.620 کیلو دالتون. یک پرتئین با ثبات بوده با ایندکس ثبات 7.02 و شاخص آلیفاتیک آن 91.06 می باشد. نیمه عمر این پروتئین در invitro، 30 ساعت می باشد. دارای 34 اسید آمینه با بار منفی و 28 اسید آمینه با بار مثبت است. با استفاده از سرور های antigenpro و allergenfp v1.0 به ترتیب ایندکس آنتی ژنیستی این پروتئین 0.847624 بود و همچنین این پروتئین فاقد خاصیت آلرژنی می باشد. نتیجه جایگاه سلولی این پروتئین با استفاده از سرور psort ii بدین صورت بود: شبکه اندوپلاسمیک 33.3%، غشای پلاسمایی 22.2%، گلژی 22.2%، سیتوپلاسمی 11.1% و میتوکندریال 11.1%. ساختار دوم این پروتئین با استفاده از سرور gor iv، 18.98% پیچ آلفا، 36.86% رشته های گسترده و 44.16% راندوم کویل ها نشان داد. همچنین ساختار سوم پروتئین با ابزار swiss-model پیش بینی گردید. چهار اپی توپ های خطی لنفوسیت های b این پروتئین با استفاده از سرور bcpreds و بیشترین امتیاز (به ترتیب 0.99، 0.83، 0.78 و 0.73) تعیین شدند. همچنین با استفاده از ابزار ellipro، 3 اپی توپ ساختاری این پروتئین به ترتیب با 4، 5 و 10 اسیدآمینه با نمرات 0.73، 0.72 و 0.61 پیش بینی شد.مطالعه حاضر نشان داد پروتئین ema-2 دارای خاصیت آنتی ژنتیکی قوی می باشد. لذا می توان از این پروتئین برای روش های تشخیصی سرولوژیکی پیروپلاسموز در اسب استفاده نمود. همچنین با استفاده از این اپی توپ های پیش بینی شده می توان حساسیت و ویژگی تشخیص تیلریا اکوئی را به طور مناسبی افزایش داد.