شناسایی بیوانفورماتیکی اعضاء جدید فاکتورهای رونویسی خانواده ی ژنی wrky در گیاه کاملینا
|
|
|
|
|
DOR
|
20.1001.2.9919029483.1399.7.1.10.3
|
|
نویسنده
|
seyed hassan pour seyede maryam ,سیدحسن پور سیده مریم ,nejadsadeghi leyla ,نژادصادقی لیلا
|
|
منبع
|
همايش علمي پژوهشي توسعه و ترويج علوم كشاورزي و منابع طبيعي ايران - 1399 - دوره : 7 - هفتمین همایش علمی پژوهشی توسعه و ترویج علوم کشاورزی و منابع طبیعی ایران - کد همایش: 99190-29483
|
|
چکیده
|
کاملینا camelina sativa یک گیاه آلوهگزاپلوئید از اعضاء خانواده ی براسیکاسه می باشد که به دلیل توانایی تولید محصولات جدید، تولیدات سوختی و خوراک دام برای محققان حائز اهمیت می باشد. فاکتورهای رونویسی wrky از بزرگترین تنظیم کننده های رونویسی در گیاهان می باشند که در مقاومت گیاه به تنش های زیستی و غیرزیستی نقش دارند. پروتئین های خانوادهwrky نامشان را 60 آمینواسید بشدت محافظت شده در جایگاهdomain wrky گرفته اند .برای شناسای اعضاء جدید این خانواده ی ژنی توالی های پروتئینی و ژنی و سایر اطلاعات مربوط به گیاه کاملینا از پایگاه های اطلاعاتی(planttfdb) و (camelina genome pororal) جمع آوری شدند. توالی پروتئینی هردو پایگاه در پایگاه ncbi، blastp شدند. برای شناسایی اعضاء جدید خانواده ی ژنی wrky در گیاه کاملینا، فاکتورهای رونویسی کاملینا با فاکتورهای رونویسی گیاه مدل آرابیدوپسیس در پایگاه ncbi نیز blastp شدند. در این بررسی 102 عضو جدید پروتئین برای گیاه کاملینا یافت شد. از 102 عضو جدید یافت شده، 8 عضو از blastp پایگاه های (camelina genome pororal) و (planttfdb) و 94 عضو جدید از blastp توالی های پروتئینی کاملینا و گیاه آرابیدوپسیس حاصل شدند.
|
|
کلیدواژه
|
کاملینا ,خانواده ی ژنی ,دمین حفاظت شده wrky ,تنش غیرزیستی.
|
|
آدرس
|
دانشگاه شهید چمران اهواز, ایران, دانشگاه شهید چمران اهواز, ایران, دانشگاه شهید چمران اهواز, ایران, دانشگاه شهید چمران اهواز, ایران
|
|
پست الکترونیکی
|
l.nejadsadeghi95@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|