پیش بینی تعامل دارو و پروتئین هدف برپایه حداقل رساندن نرم هسته‌ای وزن دار و گراف شباهت بین داروها و پروتئین های هدف
|
|
|
|
|
DOR
|
20.1001.2.9920081484.1399.1.1.41.5
|
|
نویسنده
|
قنبری سرخی علی ,هاشمی محمدرضا ,کوزه گر احسان اله
|
|
منبع
|
كنفرانس ملي تكنولوژي در مهندسي برق و كامپيوتر - 1399 - دوره : 5 - پنجمین کنفرانس ملی تکنولوژی در مهندسی برق و کامپیوتر - کد همایش: 99200-81484 - صفحه:1 -6
|
|
چکیده
|
شناسایی تعامل بین دارو و پروتئین های هدف، نقش بسیار مهمی در فرآیند کشف داور دارد. از آنجایی که انجام آزمایشات پیش‌بینی این فرآیند زمانبر، بسیار پرهزینه و خسته کننده می باشد. پیش بینی محاسباتی می تواند یک راهکار مناسبی برای کاهش فضای جستجو برای بررسی تعامل بین دارو و هدف بجای استفاده از آزمایشات پر هزینه باشد. در این مقاله یک راهکار نوین بر اساس، تعامل‌های شناخته شده در بین دارو-هدف برپایه گراف شباهت ارائه شده است. در این مقاله نشان داده شده که این کاربرد جز مسائل با مرتبه پایین می باشند که در این راستا از روش حداقل رساندن نرم هسته‌ای وزنی برای تشخیص تعامل بین دارو و هدف استفاده شده است. روش پیشنهادی بر روی چهار مجموعه داده معیار شامل آنزیم‌ها (es)، کانالهای یونی(ic) ، گیرنده‌های همراه پروتئین g (gpcrs) و گیرنده‌های هسته‌ای (nrs)، بر اساس معیارهای auc، aupr مورد ارزیابی قرار گرفته است. نتایج بدست آمده نشان دهنده بهبود عملکرد روش پیشنهادی می باشد.
|
|
کلیدواژه
|
تعاملات دارو-هدف ,پیش بینی محاسباتی ,حداقل رساندن نرم هسته‌ای وزنی ,گراف شباهت
|
|
آدرس
|
دانشگاه علم و فناوری مازندران, دانشگاه صنعتی شاهرود, دانشگاه گیلان
|
|
پست الکترونیکی
|
ehsan.koozegar@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|