ژن های اختصاصی مسیر تولید هورمون براسینواستروئید شناسایی شده بر مبنای تحلیل ترانسکریپتوم گیاه دارویی هندوانه ابوجهل (.citrullus colocynthis l)

براسینواستروئیدها (brs) گروهی از هورمون های استروئیدی گیاهی هستند که رشد و توسعه آن را تنظیم می­کنند. مطالعه­ی حاضر به منظور شناسایی شبکه­های ترانسکریپتوم ژنی مرتبط با مسیر بیوسنتزی هورمون براسینواستروئید در بافت میوه هندوانه ابوجهل اجرا شد. این داده­ها یک ترانسکریپت مرجع برای پایگاه داده ژنومی هندوانه ابوجهل برای مطالعات آینده ایجاد می­کنند. تکنیک توالی­یابی rna، بن­سازه iluumina hiseq2500 به صورت خوانش­های دو طرفه 150×2 روی گیاه هندوانه ابوجهل اجرا گردید. در مرحله­ی کنترل کیفیت با استفاده از نرم­افزارهای fastqc و trimmomatic تعداد 21,952,885 خوانش دارای کیفیت بالا تولید شد. مرحله­ی یکپارچه­سازی نوپدید با استفاده از برنامه­ی evidential-gene  تعداد 55,311 تک­ژن را حاصل کرد. از توالی تک­ژن­های یکپارچه شده علیه پایگاه kaas تعداد 13,657 تک­ژن تفسیرشده که این تعداد در 134 مسیر زیستی قرار گرفتند. با بررسی تک­ژن­های مرتبط با مسیر بیوسنتزی هورمون براسینواستروئید، 32 شناسه ژنی (k) در 8 مسیر شناسایی شد.