استفاده از توالی‌های رونوشت عقرب جهت مطالعه شبکه ژنی موثر بر سرطان

کشف تکنیک توالی‌یابی نسل جدید (ngs) موجب شناسایی ژن‌های درگیر در سیستم‌های بیولوژی مختلف گردید. این فناوری ابزار قدرتمندی در جهت تجزیه و تحلیل رونوشت‌های سلولی در بسیاری از زمینه‌های تحقیقاتی می‌باشد و استفاده از داده‌های حاصل از این فناوری تجزیه و تحلیل شبکه‌های زیستی را ممکن می‌سازد. از آنالیز شبکه‌ها می‌توان جهت شناسایی ژن‌های دخیل در چرخه‌‌های سلولی و بیماری‌زایی به‌عنوان نشانگر‌های مولکولی برای شناسایی تشخیص و تخمین اهداف بیولوژیکی بهره برد. در این پژوهش از عقرب به‌عنوان مدل جهت بررسی شبکه برهمکنش میان پروتئین‌های درگیر در سرطان استفاده شده است. پس از آنالیز ویژگی‌های توپولوژیکی شبکه ژنی داده‌های ترانسکریپتوم عقرب توسط نرم‌افزار cytoscape مشخص شد که از مجموع 195 ژن درگیر در سرطان 34 ژن دارای بیشترین درجه اثر متقابل با دیگر ژن‌ها هستند و این ژن‌ها محل تجمع سیگنال‌ها به‌حساب می‌آیند که می‌توان آن‌ها را به‌عنوان نشانگر ملکولی سرطان معرفی کرد. این نشانگرها در مسیرهای زیستی نظیر چرخه سلولی تکثیر و تمایز آپوپتوزیس و غیره نقش دارند.