تعیین ویژگی‏های مولکولی و کاتالیتیکی آنزیم زایلاناز اسیددوست باسیلوس سابتیلیس k40b

در بررسی حاضر سویه باسیلوس سابتیلیسk40b  از ریزوسفر برنج جدا و پتانسیل تولید آنزیم زایلاناز آن با استفاده از روش بیوشیمیایی ارزیابی شد.  حضور ژن زایلاناز در سویه k40b به روش مولکولی ردیابی و پس از تعیین توالی در بانک ژن مرکز اطلاعات زیست فناوری ثبت شد.  توالی این ژن شامل 563 نوکلئوتید است که یک رشته پپتیدی 187 اسید آمینه‏ای را کد می‏کند.  مقایسه توالی ژن زایلاناز سویه مورد بررسی با توالی‏های مرجع نشان می‏دهد که آنزیم تولید شده توسط سویه باسیلوس سابتیلیس k40b متعلق به خانواده 11 گلیگوزید هیدرولاز است و بالاترین شباهت را به زایلانازهای باسیلوسی دارد.  روش سطح پاسخ با استفاده از طرح مرکب مرکزی نیز به منظور تعیین دما و ph بهینه فعالیت کاتالیتیکی آنزیم زایلاناز تولید شده به کار گرفته شد.  دامنه مورد بررسی متغیرهای دما و ph در این مطالعه به ترتیب 75-25 درجه سلسیوس و5/8-5/4 بود.  بر اساس نتایج حاصل از آنالیز واریانس، مدل درجه دوم به عنوان مدل مناسب برای پیش بینی متغیر پاسخ (فعالیت آنزیم زایلاناز) پیشنهاد شد.  نتایج نشان می‏دهد که آنزیم زایلاناز تولید شده توسط سویه مورد بررسی در ph بین 2/5 تا 2/6 و دمای 50 تا 60 درجه سلسیوس بیشترین فعالیت را دارد.  همچنین، بر اساس نتایج بهینه سازی مشخص شد که ph قلیایی و دمای بیشتر از 70 و کمتر از 50 درجه سلسیوس نیز موجب کاهش قابل توجهی در فعالیت کاتالیتیکی آنزیم خواهد شد.

molecular and catalytic characterization of acidophilic xylanase bacillus subtilis k40b

bacillus subtilis k40b was isolated from rice rhizospheres and its potential for production of xylanase was evaluated using biochemical methods. the gene for xylanase in b. subtilis k40b was amplified, sequenced and assigned to the ncbi genebank. the gene size was estimated to be 563 bp encoding 413 amino acids. comparison of the xylanase gene with reference sequences showed that the xylanase of b. subtilis k40b belongs to the glycosyl hydrolyase family 11 (gh11) and was closely related to bacillus xylanase. response surface methodology using a central composite design was applied to determine the optimum temperature and ph of the xylanase b. subtilis k40b catalytic activity. testing was carried out at temperatures of 25 to 75 °c and ph values of 4.5 to 8.5. anova was used to derive a quadratic model equation for prediction of enzyme activity. results showed that the optimal conditions for xylanase activity were 6.5 ph and 50°c. alkaline ph and temperatures >70°c and <50°c resulted in a noticeable decrease in xylanase activity.