کاربرد شبیه‌سازی دینامیک مولکولی، نظریه تابعی چگالی و معادله لورنتس لورنز برای بررسی ضریب شکست ترکیب‌های مونوآمین و ایمیدازولیدین در واکنش توتومری نوع شاخه حلقه

اندازه گیری ضریب شکست توتومرها به دلیل واکنش تعادلی که بین آن‌ها وجود دارد،مشکل می باشد. لذا در این مقاله، ما از روش‌های نظری از جمله شبیه‌سازی دینامیک مولکولی و نظریه تابعی چگالی برای به دست آوردن ضریب شکست برای توتومرهای مونوآمین و ایمیدازولیدین استفاده کردیم. برای محاسبه دانسیته عددی از شبیه‌سازی دینامیک مولکولی استفاده شد وبرای این منظور از میدان نیروی gaff استفاده گردید. از سوی دیگر، محاسبات کوانتومی با سطح b3lyp و تابع پایهg**++ 6-311 برای به دست آوردن قطبش‌پذیری متوسط مولکول ها انجام گرفت. با استفاده از چگالی های به دست آمده و قطبش‌پذیری‌های متوسط، ضریب شکست مولکول ها از معادله لورنتس- لورنز محاسبه گردید. نتایج به دست آمده نشان می‌دهد که مقدارهای چگالی برای توتومرهای دارای حلقه پنج عضو ی کمتر از توتومرهای خطی می باشند. هم چنین مشخص شد که با افزایش طول موج، ضریب شکست هر دو توتومر کاهش مییابد. علاوه بر ای ن یافته ها، نتایج به دست آمده نشان داد که تغییر گروه استخلافی بر مقدارها ی ضریب شکست تاثیرگذار می باشند. چگالی ها و ضریب های شکست با نتایج حاصل از داده های acd/chemsketch مقایسه گردید.

application of molecular dynamics simulation, density functional theory and lorentz lorentz equation to investigate the refractive index of monoamine and imidazolidine compounds in chain ring type tautomeric reaction

it is hard to measure the refractive index of tautomers due to the equilibrium reaction between them. therefore, in this paper, we used theoretical methods such as molecular dynamics simulation and density functional theory to obtain the refractive index for monoamine and imidazolidine tautomers. molecular dynamics simulation was used to calculate the numerical density and gaff force field was used for this purpose.on the other hand, quantum calculations with b3lyp level and basis set of 6 311 ++ g **were performed to obtain the average polarizability of the molecules. using the obtained densities and mean polarizations, the refractive index of the molecules was calculated from the lorentz lorens equation. the results show that the density values ​​for tautomers containing a five membered ring are lower than linear ones. it was also found that with increasing wavelength, the refractive index of both tautomers decreases. in addition to these findings, the results showed that the change of the substituted group has an effect on the values ​​of the refractive index.