مطالعه کمّی میزان بیان lncrna hox a11as در بیماران ایرانی مبتلابه گلیوبلاستوما

زمینه و هدف: گلیوبلاستوما یکی از بدخیم ترین و رایج ترین تومورهای مغزی است که حدود نیمی از گلیوماها را به خود اختصاص می دهد. گلیوبلاستوما یکی از تومورهای سیستم عصبی مرکزی (cns: central nervous system) است که از بافت گلیال مغز نشئت می گیرد. هدف از این مطالعه بررسی تغییرات بیان lncrna hoxa11as& & به عنوان بیومارکر احتمالی در گلیوماست.روش بررسی: بدین منظور پس از بررسی پرونده پزشکی بیماران بیمارستان امام حسین تهران، گرفتن رضایت نامه کتبی از بیماران و گرفتن کد اخلاق این پژوهش در بیمارستان امام حسین انجام شد. بلوک های پارافینه شامل بیوپسی بافت توموری مغز از سال 1394 تا 1396 جمع آوری شد و متخصص پاتولوژیست آن ها را تایید و تعیین درجه کرد. در این پروژه، 50 نمونه درجه 1 و2 و 50 نمونه درجه 3 و4 بررسی شد. برای تمام نمونه های بافتی اهداشده بیماران، استخراج rna و سنتز cdna صورت گرفت. سپس پرایمر و پروب اختصاصی طراحی و میزان بیان ژن hoxa11as& & با استفاده از روش realtime pcr بررسی شد. میانگین سن افراد بررسی شده 16.416 &± 43.70 سال بود. تجزیه وتحلیل آماری داده ها به صورت توصیفی و تحلیلی با استفاده از نرم افزار spss نسخه 20 انجام شود. همچنین برای مقایسه میزان بیان این ژن در بافت تومورال با درجه پایین تر و بافت تومورال با درجه بالاتر از آزمون آماری تی مستقل استفاده شد.یافته ها: نتایج نشان داد نمونه های توموری با درجه سه و چهار، 2.76 برابر نمونه های توموری با درجه یک و دو افزایش بیان (fold change) داشتند که ازنظر آماری این فاصله معنی دار است.نتیجه گیری: نتایج بررسی کمّی نشان داد بیان ژن hoxa11as& افزایش معنی داری با افزایش درجه بیماری دارد (0.0002=p).

Investigation of Long Noncoding RNA HOX A11AS Expression in Iranian Patients with Glioblastoma: A Quantitative Study

Background and Objectives: Glioblastoma is one of the most malignant and common brain tumors, accounting for about half of all gliomas. Glioblastoma is a central nervous system tumor that originates from the glial tissue of the brain. The present study aimed to investigate changes in the expression of long noncoding RNA HOXA11AS as a possible biomarker in glioma. Methods: For the purposes of the present study, first, the medical records of the patients in Imam Hossein Hospital in Tehran, Iran were reviewed. The ethical considerations were respected as well; accordingly, written informed consent was obtained from the patients and the code of ethics was achieved as well. Finally, the paraffin blocks, including the biopsy of brain tumor tissue of the patients who referred to Imam Hossein Hospital during 201517 were collected and their degrees were confirmed by the pathologist. In total, 50 samples of grades 1 and 2 as well as 50 samples of grades 3 and 4 were examined in this research project. The RNA extraction and cDNA synthesis were performed for all the tissue samples donated by the patients. Subsequently, a specific primer and probe were designed and the expression of the HOXA11AS gene was investigated using realtime polymerase chain reaction technique. The mean age of the subjects was 43.70&±16.416 years. The collected data were analyzed in SPSS software (version 20) using descriptive and analytical statistics. Moreover, the expression levels of this gene in lower and highergrade tumor tissues were compared using the unpaired samples ttest. Results: Based on the results, the tumor samples with grade three and four underwent a 2.76 fold increase in expression (fold change), compared to tumor samples with grade one and two. This difference was statistically significant. Conclusion: Based on the findings, it can be concluded that the expression of the HOXA11AS gene has a significant positive relationship with the degree of disease (P=0.0002).