استخدام قواعد البیانات لتحدید مواضع القطع ورسم خارطة التقیید للجین المشفر لانزیم اللایبیز من بکتریا Bacillus stearothermophilus
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
جاسم حمید مجید
|
|
منبع
|
journal of biotechnology research center - 2011 - دوره : 5 - شماره : 1 - صفحه:22 -30
|
|
چکیده
|
والبروتینات ذات العلاقة فی تصمیم برنامج (rebase) استخدمت قواعد البیانات الخاصة بانزیمات التقیی تنفیذی بلغة quick basic لتحدید مواضع القطع ورسم خارطة التقیید لجین اللایبیز من بکتریا bacillus . stearothermophilus وقد تم التمکن باستخدام ھذا البرنامج الذی یعد ذو فائدة کبیرة فی التنبو بانماط التقطیع لجزیئات الدنا الارتباطیة من تحدید مواضع القطع الخاصة بستة عشر انزیم من بین 46 نوع من انزیمات التقیید المختلفة التی شملتھا الدراسة . وقد اظھرت النتائج ان کل من انزیمات التقیید و smai و bcli و bani و haeii و ecorv و acci و bsphi و eagi و clai و ddei و sali و xhoi naei و kspi و ssti و cfri تمتلک تسلسلات تعرفیھ ومواضع قطع فی مناطق مختلفة من تعاقب الجین . وقد تم تحدید تلک المواضع بدقة وحساب حجوم القطع الناتجة فی حالة المعاملة بھذه الانزیمات . کما تم التمکن من رسم خارطة التقیید لجین اللایبیز التی تبین المواضع الحساسة لانزیمات التقیید وتحدید المنطقة المشفرة للانزیم والبالغ حجمھا 1254 زوج قاعدی ضمن التعاقب النکلیوتیدی الکامل للجین البالغ حجمھ 1725 زوج قاعدی .
|
|
|
|
|
آدرس
|
جامعة النھرین, کلیة العلوم, العراق
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|