مالتیپل اسکلروزیس و مسیر سیگنال دهی mapk : یک مطالعه مبتنی بر ریزآرایه

مقدمه: بیماری مالتیپل اسکلروزیس (ms) یک بیماری التهابی دمیلینه کننده‌ی سیستم اعصاب مرکزی است. هدف از مطالعه‌ی کنونی بررسی کتابخانه‌های ریز آرایه موجود در ncbi و آنالیز عملکرد کتابخانه برای بررسی ژن های تغییربیان یافته و استخراج مسیرهای سلولی درگیر در پاتوژنز ms بود.روش کار: داده‌های موجود در مجموعه داده gse21942 ، در ابتدا توسط geo2r و سپس توسط نرم افزار r نسخه 4.2.0 آنالیز شدند. نرمال سازی داده‌ها و استخراج ژن‌های دارای تفاوت بیان معنادار (degs) انجام شد و آنالیز عملکرد توسط enrichr و david 6.8 انجام شد. یافته‌ها: 300 ژن در گروه ms با log2fc>1 افزایش بیان و 205 ژن با log2fc<-1 کاهش بیان داشتند. مسیر پیام دهی گیرنده سلول b و مسیر پیام دهی mapk کیناز مهمترین مسیر استخراج شده است.نتیجه گیری: مسیرهای استخراج شده برای ژن های تغییر بیان یافته با مسیر پیام دهی mapk کیناز مرتبط می باشند که ممکن است طیف گسترده ای از فرآیندهای سلولی از جمله تکثیر، تمایز، آپوپتوز و پاسخ های استرس را در بیماری ms تنظیم کنند. لذا مسیر اشاره شده احتمالا بتوانند به عنوان اهدافی جهت درمان ms مورد استفاده قرار گیرد.

multiple sclerosis and the mapk signaling pathway: a microarray-based study

background: multiple sclerosis (ms) is an inflammatory demyelinating disease of the central nervous system. the aim of the current study was to search microarray libraries and perform functional analysis on extracted genes to predict their role in the pathogenesis of ms.materials and methods: the data in the gse21942 dataset were first analyzed by geo2r and then by r software version 4.2.0. normalization of data and extraction of genes with significant expression differences (degs) were performed and performance analysis was performed by enrichr and david 6.8.results: 300 genes in the ms group had increased expression with log2fc>1 and 205 genes had decreased expression with log2fc<-1. the b cell receptor signaling pathway and the mapk kinase signaling pathway were the most important pathways extracted.conclusion: the extracted pathways for the altered genes are related to the mapk kinase signaling pathway, which may regulate a wide range of cellular processes including proliferation, differentiation, apoptosis, and stress responses in ms. therefore, the indicated pathways could potentially be used as targets for ms therapy.