مسیر پیام دهی pi3k/akt و سرطان آناپلاستیک تیروئید: یک مطالعه مبتنی بر ریز آرایه

مقدمه: سرطان آناپلاستیک تیروئید (atc) شکل تمایز نیافته‌ای از سرطان تیروئید است که کشندگی بالایی دارد. هدف از مطالعه حاضر جستجو در کتابخانه‌های ریزآرایه موجود در مرکز ملی اطلاعات زیست‌فناوری (ncbi) و آنالیز عملکرد بر روی ژن های استخراج شده بود تا نقش آن‌ها در پاتوژنز atc پیش بینی گردد.روش کار: داده‌های موجود در مجموعه داده gse33630 ، در ابتدا توسط geo2r و سپس توسط نرم افزار r نسخه 4.2.0 آنالیز شدند. نرمال سازی داده‌ها و استخراج ژن‌های دارای تفاوت بیان معنادار (degs) انجام شد و آنالیز عملکرد توسط enrichr و david 6.8 انجام گرفت. یافته‌ها: نتایج نشان داد که 1705 ژن با log2fc>1 افزایش بیان و 2740 ژن با log2fc< 1 کاهش بیان داشتند. همچنین مسیر پیام دهی pi3k/akt و فاکتورهای نسخه برداری irf8، tcf4، cbepb و jund با ژن‌های افزایش بیان یافته مرتبط هستند.نتیجه گیری: افزایش فعالیت مسیر پیام دهی pi3k akt و همچنین فاکتورهای نسخه برداری irf8، tcf4، cbepb و jund در سلول‌های تیروئید احتمالا منجر به ایجاد یا پیشرفت سرطان atc می گردد.

pi3k/akt signaling pathway and anaplastic thyroid cancer: a microarray based study

introduction: anaplastic thyroid cancer (atc) is an undifferentiated form of thyroid cancer that is highly lethal. the aim of the current study was to search the microarray libraries available in the national center for biotechnology information (ncbi) and analyze the function of the extracted genes to predict their role in the pathogenesis of atc.materials and methods: the data in the gse33630 dataset were first analyzed by geo2r and then by r software version 4.2.0. normalization of data and extraction of genes with significant expression differences (degs) were performed and performance analysis was performed by enrichr and david 6.8.results: the analyses showed that 1705 genes with log2fc>1 had increased expression and 2740 genes with log2fc< 1 had decreased expression. also, the pi3k/akt signaling pathway and the transcription factors irf8, tcf4, cbepb and jund are related to the increased expressed genes.conclusion: increased activity of pi3k akt signaling pathway as well as transcription factors irf8,tcf4, cbepb and jund in thyroid cells probably leads to the development or progression of atc cancer.