بررسی بیوانفورماتیکی برای تعیین بیومارکرهای کلیدی در سرطان پروستات

مقدمه: درمان موثر در سرطان پروستات اهمیت ویژه ای دارد. حفظ کیفیت زندگی افراد مبتلا به این نوع رایج سرطان حیاتی است. یافتن روش های درمانی جدید مبتنی بر علوم مدرن همچون بیوانفورماتیک برای امکان داشتن برنامه های پزشکی شخصی متناسب با نیازهای فرد ضروری است. امکان برنامه‌های پزشکی شخصی متناسب با نیازهای فرد را فراهم می‌کند. علاوه بر این،  پیشرفت های مذکور می توانند به توسعه اقدامات پیشگیرانه در راستای کاهش میزان خطر ابتلا به این نوع سرطان کمک کنند.روش کار: مجموعه داده‌های بیان ژن gse55945 از ncbi-geo بارگذاری و ژن‌های دارای تفاوت بیان (deg) تجزیه و تحلیل شدند. نقش ژن ها در فرآیندهای بیولوژیکی و مسیرهای غنی‌سازی آن ها در پایگاه enrichr توسط دانشنامه ژن و ژنوم کیوتو (kegg)  reactome، bioplanet و غیره نمایش داده شد. همچنین شبکه‌های پروتئین-پروتئین (ppi) ترسیم شد.نتایج: در مجموع هفت ژن کلیدی شامل cck، nox4، calm1، cacna1d، mylk، cav1 و aox1 شناسایی شد. تحلیل های مربوط به فرآیندهای مولکولی نشان داد که بیشتر ژن‌های دارای تفاوت بیان در سازوکار متابولیسم دارو نقش دارند. همچنین، نتایج نشان داد که عملکرد مولکولی اکثر ژن‌ها مربوط به فرآیندهای وابسته به g-protein  و متابولیسم اینوزیتول فسفات است. نتیجه گیری: ژن های دارای تفاوت بیان، ژن های کلیدی و مسیرهای سیگنالی شناسایی شده در این مطالعه ممکن است به درک سازوکارهای مولکولی سرطان پروستات کمک کرده و اهداف احتمالی برای تشخیص و درمان این بیماری ارائه دهند.

bioinformatics study to determine key biomarkers in prostate cancer

introduction: the importance of effective treatment for prostate cancer cannot be ignored. maintaining the quality oflife of people with this common type of cancer is vital. identifying new treatments through modern sciences such as bioinformatics is essential and provides the possibility of personalized medical programs tailored to individual needs. in addition, these advances can help develop preventive measures that can ultimately reduce the risk of developing this type of cancer.materials and methods: we downloaded the gse55945 gene expression data set from ncbi-geo and analyzed thedifferentially expressed genes (deg). the role of genes in biological processes, and the enrichment pathways of genes in the enrichr database are displayed by the kyoto encyclopedia of genes and genomes (kegg), reactome, bioplanet, etc. also, protein-protein (ppi) networks drawn and discussed.results: a total of 7 hub or key genes, including cav1, mylk, cacna1d, calm1, nox4, cck, and aox1, were identified. analyzes related to molecular processes showed that most genes with differential expression are involved in the &mechanism of drug metabolism&. also, the results showedthat the molecular function of most genes is related to &g-protein dependent&, and &inositol phosphatemetabolism& processes.conclusion: degs, key genes and signaling pathways identified in this study may help to understand the molecularmechanisms of prostate cancer and provide possible targets diagnosing and treating this disease.